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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 求大神告知用MS磷酸铁锂模型时磷酸铁锂的原子坐标
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范小现

新虫 (初入文坛)

[求助] 求大神告知用MS磷酸铁锂模型时磷酸铁锂的原子坐标 已有1人参与

做毕业设计要分析磷酸铁锂建立模型时有原子在外面，rebuild后模型只是大小变了。所以想知道有没有准确的原子坐标。
谢谢各位了。

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自恕
1楼 2017-05-14 10:21:35
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zhangfrank

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
范小现(漫天飘雪代发): 金币+2, 谢谢交流 2017-05-14 19:27:21
没有明白你的意思。
大概猜测了下，计算的时候是原子都在晶格内的，但是如果你是非规则性晶体，可能某些原子会显示在晶格外，比如坐标0.9的原子可能显示在坐标-0.1的位置，这样的话在计算的时候是没有关系的。
不知道是不是跟你遇到的情况一样。
至于准确原子坐标，MS中鼠标选中原子左下角窗口就有坐标（包括相对坐标和绝对坐标）
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计算顺利点吧
2楼2017-05-14 17:05:18
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曲婉风荷

新虫 (小有名气)
(⊙o⊙)…

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3楼2017-05-14 17:44:49
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范小现

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhangfrank at 2017-05-14 17:05:18
没有明白你的意思。
大概猜测了下，计算的时候是原子都在晶格内的，但是如果你是非规则性晶体，可能某些原子会显示在晶格外，比如坐标0.9的原子可能显示在坐标-0.1的位置，这样的话在计算的时候是没有关系的。
不 ...

我想问问为什么在模型优化的时候会有原子跑到晶胞外面，而原始模型里的原子都是在晶胞里的。谢谢了。

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自恕
4楼2017-05-14 19:26:37
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zhangfrank

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 范小现 at 2017-05-14 19:26:37
我想问问为什么在模型优化的时候会有原子跑到晶胞外面，而原始模型里的原子都是在晶胞里的。谢谢了。
...

那就是我说的，只是显示问题。没关系。用vesta打开你的优化后结构，可以有多重显示方式。【在edit-bond里面】
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计算顺利点吧
5楼2017-05-14 19:49:20
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范小现

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhangfrank at 2017-05-14 19:49:20
那就是我说的，只是显示问题。没关系。用vesta打开你的优化后结构，可以有多重显示方式。【在edit-bond里面】...

那是不是说能够继续优化？但是我们老师有讲过优化的时候不可以有原子在外面。

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自恕
6楼2017-05-14 23:19:57
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Saber_李

新虫 (初入文坛)
用findlt软件搜索无机晶体的各个参数再构建

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7楼2017-05-15 01:02:50
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b0ing

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 范小现 at 2017-05-14 19:26:37
我想问问为什么在模型优化的时候会有原子跑到晶胞外面，而原始模型里的原子都是在晶胞里的。谢谢了。
...

也有可能是显示的问题吧，你把晶胞沿着跑出去的原子那个方向扩展一下，会发现那个原子实际上是在另外一个晶胞里面的。然后你可以对照晶胞的相关参数，对跑到外面的原子空间点位进行修改，基本就能让原子到晶胞的里面去了，不过是在另外一个完全相反的方向。
另外，一般原始建立的晶胞模型，都不算是最稳定的结构，优化之后的原子空间点位都会有变化的。
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It'snotyourfatebutyourchoice.
8楼2017-07-06 17:25:29
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