应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VASP后台提交任务出现一个奇怪的问题
51/1返回列表
查看: 1715  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

chinasunny08

至尊木虫 (著名写手)

[求助] VASP后台提交任务出现一个奇怪的问题 已有1人参与

服务器共12个节点，vasp版本4.6，原来从没遇到这种问题：
如下图为后台提交任务的脚本，当nodes=1时，只会出现任务编号，立马停止，不会往下计算；当nodes=2时，可正常后台提交任务，正常运算；当nodes=3时，也可正常后台提交，正常运算。
可以确定硬件没有问题，是PBS系统还是哪里的问题，请大神指点

VASP后台提交任务出现一个奇怪的问题
server.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2017-05-13 23:02:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

y.q.liu

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
如果是1个节点不能算，多个就能算，有可能是一个节点的内存不够；另外INCAR输入参数也可能有影响
建议贴出错误信息和INCAR文件。
赞一下 回复此楼
2楼2017-05-15 09:54:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chinasunny08

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by y.q.liu at 2017-05-15 09:54:56
如果是1个节点不能算，多个就能算，有可能是一个节点的内存不够；另外INCAR输入参数也可能有影响
建议贴出错误信息和INCAR文件。

出错信息就是上面描述的，OUTCAR和vasp.log没有写入。
内存不够的问题也可以排除，因为同样的任务之前用一个节点可正常计算，而且任务不大，只有几个原子。
下图是INCAR和各节点的数据量，是不是因为node1没有空间的原因？
VASP后台提交任务出现一个奇怪的问题-1
INCAR.jpg


VASP后台提交任务出现一个奇怪的问题-2
server1.jpg
赞一下 回复此楼
3楼2017-05-15 11:59:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

y.q.liu

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by chinasunny08 at 2017-05-15 11:59:19
出错信息就是上面描述的，OUTCAR和vasp.log没有写入。
内存不够的问题也可以排除，因为同样的任务之前用一个节点可正常计算，而且任务不大，只有几个原子。
下图是INCAR和各节点的数据量，是不是因为node1没有空 ...

先解决存储空间再试下。除了/data/node1其它接近100%的顺便也处理下。
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

chinasunny08
4楼2017-05-16 09:03:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chinasunny08

至尊木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by y.q.liu at 2017-05-16 09:03:13
先解决存储空间再试下。除了/data/node1其它接近100%的顺便也处理下。...

搞了好久，还是不清楚怎么清理分节点下的数据
Redhat系统和PBS作业调度
赞一下 回复此楼
5楼2017-05-16 15:30:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chinasunny08 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 8/400 2026-11-01 16:58 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 13/650 2026-11-01 16:48 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 14/700 2026-11-01 16:32 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 7/350 2026-11-01 15:08 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-01 15:04 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 6/300 2026-11-01 15:01 by BCdvBAEpt3zm
[基金申请] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 9/450 2026-11-01 14:55 by BCdvBAEpt3zm
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 10/500 2026-11-01 14:50 by BCdvBAEpt3zm
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 13/650 2026-11-01 14:37 by BCdvBAEpt3zm
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 10/500 2026-11-01 14:35 by BCdvBAEpt3zm
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 14/700 2026-11-01 14:24 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 6/300 2026-11-01 12:53 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 17/850 2026-11-01 12:24 by BCdvBAEpt3zm
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 11/550 2026-11-01 12:24 by BCdvBAEpt3zm
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 16/800 2026-11-01 12:14 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 18/900 2026-11-01 12:11 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 4/200 2026-11-01 11:01 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 9/450 2026-11-01 10:53 by BCdvBAEpt3zm
[基金申请] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 14/700 2026-11-01 10:43 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 申博求助 20+3 Katrinae 2026-10-26 4/200 2026-10-27 09:56 by 北京莱茵编辑
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭