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【求助】Oniom若干问题求教
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我做了两层oniom计算，high用rb3lyp/6-31g(d) low用 uff 有以下几个问题求教 1. 最后结果中low层怎么成了 UFF/ZDO 2. 我从out里找到下面几行 ONIOM: gridpoint 1 method: low system: model energy: 0.342298559852 ONIOM: gridpoint 2 method: high system: model energy: -817.554558911790 ONIOM: gridpoint 3 method: low system: real energy: 0.324262727175 2是high层，用rb3lyp算的，1和3是不是用uff算出来low层部分和总的？ 我如果算过渡态的势垒，是不是只用high层的能量就行了？ 3.关于频率计算，我是直接在opt后加上 freq，这样可以吗？ gaussian手册中说： 如果有某一指定的模型需要进行数值频率计算，那么将对所有的模型进行数值频率计算，即使是对这些模型也能进行解析频率计算。 这什么意思？ 最后得到的零点能校正是只对high层部分吗？ 4.我用amber力场为什么老出错？是需要自己在输入里加什么参数吗？ [ Last edited by vallen on 2009-1-8 at 11:42 ] |
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2楼2009-09-11 11:19:46