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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 请问什么是保守序列？一般怎么应用？
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melodyxin

铜虫 (小有名气)

[交流] 请问什么是保守序列？一般怎么应用？

我的目的基因序列除催化区域、linker等元件外，存在一段36-40 aa 的保守序列，请问什么是保守序列？它是否参与基因的表达？一般采用哪些策略处理这段序列？
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1楼 2009-01-07 15:56:12
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melodyxin

铜虫 (小有名气)
有人在吗？
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2楼2009-01-07 17:09:01
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zhaocy8903

木虫 (知名作家)
第二,三个问题实在不知道是什么意思
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3楼2009-01-07 19:43:02
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melodyxin

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhaocy8903 at 2009-1-7 19:43:
第二,三个问题实在不知道是什么意思

文字的语法应该没错吧？其实问题就在于我想人工改造目的基因后进行表达，但不知保守序列是否也要改造甚至删除。因为根据之前的报道，这段保守序列位于催化区域外，基本上不参与催化活性，但既然称作“保守”，大概也不能贸然删除吧？

是因为你觉得问题太简单，不知道怎么表述才好吧？

呵呵，那就说说你自己对保守序列的了解也行啊。
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4楼2009-01-08 10:42:11
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可以吗

银虫 (小有名气)
我理解保守序列为：所有这些相近物种的 这段序列的 碱基是相同的，几乎没有碱基的突变或变异

至于要怎么处理，为什么要处理呢？不明白

[ Last edited by 可以吗 on 2009-1-8 at 10:57 ]
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5楼2009-01-08 10:55:43
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melodyxin

铜虫 (小有名气)
因为是外源基因的表达，两种宿主菌对密码子偏好很不一样，需要改造基因片段啊。
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6楼2009-01-08 15:03:25
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zhaocy8903

木虫 (知名作家)
密码子偏好不应该成为改造基因的主要原因
一般来讲保守序列的功能都比较重要的
你的保守序列虽然不是酶的活性位点,但对维持蛋白构象可能有作用
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7楼2009-01-08 15:25:46
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melodyxin

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhaocy8903 at 2009-1-8 15:25:
密码子偏好不应该成为改造基因的主要原因
一般来讲保守序列的功能都比较重要的
你的保守序列虽然不是酶的活性位点,但对维持蛋白构象可能有作用

虽然大的来讲，密码子偏好不是主因，但对于某个特定宿主就不一定了吧。
去年刚刚有文献报道和它同一来源的相同家族的原始基因无法在我选定的宿主菌内表达，必须改变密码子。
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8楼2009-01-08 16:48:17
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zhaocy8903

木虫 (知名作家)
毕赤酵母?
AT含量太高?
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9楼2009-01-08 20:15:00
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davidg

铜虫 (初入文坛)
该讨论有意思,对初学者有益.
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10楼2009-01-09 08:00:23
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