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用Ms画结构时，原子的坐标是怎么得到的呢？ 已有1人参与
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很多人说查数据库，我想知道数据库里面的数据是怎么得到的呢，用什么方法可以测得，或者计算得到的？ 发自小木虫Android客户端 |
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jiagle
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2楼2017-05-07 12:50:09
3楼2017-05-07 13:02:33
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冰点降温: 金币+1, 谢谢专家解答，辛苦了。 2017-05-08 09:15:36
晨晨666(冰点降温代发): 金币+2 2017-05-08 09:15:40
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晨晨666(冰点降温代发): 金币+2 2017-05-08 09:15:40
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自己去看如下例子，不相信你还看不明白： *data for ICSD #59253 CopyRight ?2006 by Fachinformationszentrum Karlsruhe, and the U.S. Secretary of Commerce on behalf of the United States. All rights reserved. Coll Code 59253 Rec Date 1999/01/19 Chem Name Dibarium Magnesium Bis(phosphate(V)) Structured Ba2 Mg (P O4)2 Sum Ba2 Mg1 O8 P2 ANX AB2C2X8 D(calc) 4.3 Title Dibarium magnesium phosphate Author(s) Lucas, F.;Wallez, G.;Jaulmes, S.;Elfakir, A.;Quarton, M. Reference Acta Crystallographica C (39,1983-) (1997), 53, 1741-1743 Unit Cell 5.294(4) 8.837(4) 16.1430(80) 90. 90.60(5) 90. Vol 755.18 Z 4 Space Group P 1 21/n 1 SG Number 14 Cryst Sys monoclinic Pearson mP52 Wyckoff e13 R Value .033 Red Cell P 5.294 8.837 16.143 90 90.6 90 755.178 Trans Red 1.000 0.000 0.000 / 0.000 1.000 0.000 / 0.000 0.000 1.000 Comments Calculated density unusual but tolerable. Atom # OX SITE x y z SOF H Ba 1 +2 4 e 0.29325(2) 0.29665(2) -.019510(8) 1. 0 Ba 2 +2 4 e 0.74591(2) 0.84330(2) 0.271420(8) 1. 0 Mg 1 +2 4 e 0.2719(1) 0.48431(9) 0.36579(5) 1. 0 P 1 +5 4 e 0.7358(1) 0.58814(7) 0.42233(4) 1. 0 P 2 +5 4 e 0.2498(1) 0.60831(7) 0.16649(4) 1. 0 O 1 -2 4 e 0.7863(3) 0.5834(2) 0.5147(1) 1. 0 O 2 -2 4 e 0.5262(3) 0.6984(2) 0.4017(1) 1. 0 O 3 -2 4 e 0.6516(3) 0.4346(2) 0.3874(1) 1. 0 O 4 -2 4 e 0.9793(2) 0.6366(2) 0.37662(9) 1. 0 O 5 -2 4 e 0.3457(3) 0.5296(2) 0.2440(1) 1. 0 O 6 -2 4 e 0.3570(3) 0.5261(2) 0.0922(1) 1. 0 O 7 -2 4 e 0.3524(3) 0.7720(2) 0.1676(1) 1. 0 O 8 -2 4 e -.0429(3) 0.6108(2) 0.1662(1) 1. 0 Lbl Type U11 U22 U33 U12 U13 U23 Ba1 Ba2+ 0.01425(8) 0.01373(8) 0.00929(8) -.00203(5) 0.00097(5) -.00069(5) Ba2 Ba2+ 0.01609(8) 0.01327(9) 0.00888(8) 0.00000(5) 0.00043(5) 0.00160(5) Mg1 Mg2+ 0.0104(4) 0.0151(4) 0.0112(4) 0.0012(3) -.0009(3) 0.0001(4) P1 P5+ 0.0095(3) 0.0119(3) 0.0100(3) -.0002(2) 0.0017(2) 0.0000(3) P2 P5+ 0.0133(3) 0.0099(3) 0.0080(3) -.0007(3) 0.0007(3) 0.0011(3) O1 O2- 0.0236(9) 0.043(2) 0.0088(9) -.0048(8) 0.0029(7) 0.0027(9) O2 O2- 0.0182(8) 0.0199(9) 0.019(1) 0.0096(7) 0.0052(7) 0.0038(8) O3 O2- 0.0128(8) 0.0082(8) 0.0153(8) 0.0003(6) -.0001(6) 0.0006(7) O4 O2- 0.0062(8) 0.0221(9) 0.0125(9) 0.0008(6) 0.0030(6) 0.0026(7) O5 O2- 0.0169(8) 0.029(1) 0.0198(9) 0.0117(8) -.0005(7) 0.0052(8) O6 O2- 0.036(1) 0.018(1) 0.0185(9) -.0139(8) 0.0151(8) -.0092(8) O7 O2- 0.0171(8) 0.0097(9) 0.023(1) -.0027(7) -.0048(7) -.0017(7) O8 O2- 0.0138(8) 0.022(1) 0.021(1) -.0026(7) -.0015(7) 0.0062(8) *end for ICSD #59253 |
4楼2017-05-07 13:19:12
