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[交流] Nature Genetics:绘成水稻遗传特性细胞图谱

Nature Genetics:绘成水稻遗传特性细胞图谱
2009-01-07 《自然―遗传学》
内容快照:

耶鲁大学的研究者绘制了水稻遗传特性的细胞图谱,非常详细地说明了在活体生物体内细胞中基因的开关时间。研究结果发表在2009年1月4日的《自然—遗传学》(Nature Genetics)上。

在为期5年的研究工作中,产生了海量数据,记录了世界上最重要的水稻的生命周期中关键的40种不同细胞的差异和相似性。分子、细胞和发育生物学教授Timothy Nelson说:“所有的谷物都会从这张图谱提供的知识及其衍生出来的工具而收益。例如,科学家希望能从其中发现负责光合作用的基因网络,这有助于提高食品和生物质能源的产量。”

这个图谱是由细胞的特殊转录组所组成的,大量的资料组很好的注释了水稻30000种基因中,每一种的相对活性及其对应的细胞类型。研究中涉及的40个转录组可以在40中细胞中对每个基因的活性进行比对,包括根、茎和胚芽的不同发育时期的细胞。最后,耶鲁大学的研究团队希望能再增加40种不同类型细胞的数据,并在网上发布,供全世界的研究者使用。

Nelson说,“这种图谱为研究人员提供了一种很独特的资源——关于不同细胞中基因与基因的关系,如何产生组织、器官和是全株植物发挥功能的可以为人们所理解的数据。许多重要类型细胞非常难以收集,因此对图谱的解读也是在技术上取得的一项重要成就。

图谱的数据可以帮助研究者区分在细胞的不同阶段中起作用的基因、提供确定基因在机体形成中所扮演角色的线索,另外科学家还可以找出关键的持家基因——那些在所有细胞整个周期中都起关键作用的基因。这些数据是深层发掘任何基因或者生物学过程中细胞信息的重要资源。(来源:中国科学院青岛生物能源与过程研究所 苏郁洁/编译)
  
(《自然—遗传学》(Nature Genetics),doi:10.1038/ng.282,Yuling Jiao,Timothy Nelson)
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