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791618275

捐助贵宾 (正式写手)

[求助] 单点能的一些新手问题 已有2人参与

单点能是优化结构也能得到么?  这个单点能不需要计算就会得到么?

这是我练习的一个单点能计算为什么通入进去得不到结果啊
%chk=H2CO.chk
#P RHF/6-31G(d)Pop=Full Test

Title Card Required

0 1
C                 -1.17706237    1.03621729    0.00000000
O                  0.05025463    1.03621729    0.00000000
H                 -1.76920737    1.97562129    0.00000000
H                 -1.76920737    0.09681329    0.00003900

1 2 2.0 3 1.0 4 1.0
2
3
4


在我通入SCRT时候 有这么一句话[neduliu13@cluster jiaquan]$ run.g09 H2CO.gjf
qsub: Job exceeds queue resource limits MSG=cannot locate feasible nodes (nodes file is empty or all systems are busy)
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Yan_Jordan

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
感觉不是高斯本身计算的问题。
最后一句应该是cluster并行计算的时候提示出的问题
高斯本身的并行是节点内并行,而不同节点的并行需要用到Linda
需要你做好计算资源的定义

如果做并行,你的输入文件开头还应该加一句 %nprocshared=N
N与你用到的核数相等为最优
2楼2017-05-05 17:05:43
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791618275

捐助贵宾 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Yan_Jordan at 2017-05-04 21:05:43
感觉不是高斯本身计算的问题。
最后一句应该是cluster并行计算的时候提示出的问题
高斯本身的并行是节点内并行,而不同节点的并行需要用到Linda
需要你做好计算资源的定义

如果做并行,你的输入文件开头还应该 ...

不懂啥意思啊,这个单点能是需要计算的么?我看gauss书上说好像是可以优化之前计算一下,那计算这个有什么用呢,,,还有优化的时候是不是带有单点能的计算了?
3楼2017-05-05 18:28:32
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Yan_Jordan

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
791618275: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 谢谢 2017-05-06 10:41:47
引用回帖:
3楼: Originally posted by 791618275 at 2017-05-05 18:28:32
不懂啥意思啊,这个单点能是需要计算的么?我看gauss书上说好像是可以优化之前计算一下,那计算这个有什么用呢,,,还有优化的时候是不是带有单点能的计算了?...

只做单点能计算时是对一个输入结构的整体能量的计算
而优化是通过改变结构,使整体能量达到最低,其目的是为了找到最优的理论结构
(可以说单点能计算是优化计算的基础)

优化之前做一次单点能计算,应该是为了能看到优化前后能量的变化。

优化过程其实就是,(通过理论)每次改变一点结构其实都需要一次单点能计算
4楼2017-05-05 18:40:55
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