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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 请教大家如何将高通量测序的fq文件拼接、转换为fasta文件？谢谢啦！
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杏林湾畔

金虫 (初入文坛)

[求助] 请教大家如何将高通量测序的fq文件拼接、转换为fasta文件？谢谢啦！ 已有2人参与

大家好。测序结果返回的原始数据是Sample1.f.fq和Sample1.r.fq。

请问如何将这两个文件拼接成一个文件 Sample1. fasta呢？

PS. 这是准备往NCBI上传数据用的。。。毫无经验的新生快被NCBI折磨的发疯了。。。。谢谢大家先帮我解决这第一个问题。。。不胜感激！
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1楼 2017-05-04 09:26:55
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vagbio

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
杏林湾畔(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-05-04 16:41:15
杏林湾畔: 金币+5, ★★★很有帮助 2017-05-05 11:03:45
软件NextGENe可以，里面有merger工具，不需要脚本和代码，页面显示的。
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2楼2017-05-04 11:28:55
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MAS_rice

至尊木虫 (著名写手)
Ugene也可以

发自小木虫IOS客户端
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竹杖芒鞋轻胜马，谁怕，一蓑烟雨任平生；回首向来萧瑟处，归去，也无风雨也无晴
3楼2017-05-06 09:08:26
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三点水木

新虫 (初入文坛)
西门吹雪170: 应助指数-1, 无应助 2017-05-11 07:46:26
引用回帖:
3楼: Originally posted by MAS_rice at 2017-05-06 09:08:26
Ugene也可以

我看了你写的，下载了软件，但是不知道怎么操作，能否给下具体的流程，谢谢啦。
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4楼2017-05-11 00:04:22
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三点水木

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by vagbio at 2017-05-04 11:28:55
软件NextGENe可以，里面有merger工具，不需要脚本和代码，页面显示的。

你好，我没找到这个软件，不知道怎么做，能否指点一下，谢谢啦
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5楼2017-05-11 00:05:17
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三点水木

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by vagbio at 2017-05-04 11:28:55
软件NextGENe可以，里面有merger工具，不需要脚本和代码，页面显示的。

15jmzhu@stu.edu.cn
我的邮箱，如果您方便的话，可否给些关于 nextgene的软件和具体用法，不胜感激。
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6楼2017-05-11 00:24:40
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三点水木

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by MAS_rice at 2017-05-06 09:08:26
Ugene也可以

我下载了英文版的指导，不过真的不知道从哪下手，15jmzhu@stu.edu.cn
我的邮箱，如果您方便的话，还请多多指导，非常感谢。
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7楼2017-05-11 00:25:52
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