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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知

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huangyc

木虫 (正式写手)

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[交流] 【讨论】是ＮＥＢ还是ＶＡＳＰ编译出问题了？

我编译通过的ＶＡＳＰ植入了一些tools，用来做诸如climbing-NEB等。但发现用新编的VASP做regular-NEB时会出现如下错误：（out文件）
vasp.4.6.21  23Feb03 complex
vasp.4.6.21  23Feb03 complex
vasp.4.6.21  23Feb03 complex
vasp.4.6.21  23Feb03 complex
ERROR: the following files does not exist POSCAR
ERROR: the following files does not exist POSCAR
ERROR: the following files does not exist POSCAR
ERROR: the following files does not exist POSCAR
但可以做吸附，不过感觉时间要比以前长！

同样的任务，如果用普通编译的VASP（/bin）regular-NEB正常结束，且吸附任务要快！

不知道是什么原因，不知各位是否遇到过？是NEB的问题还是编译VASP中出现的问题，谢谢。新年快乐

[ Last edited by mingdong on 2009-12-9 at 08:34 ]

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1楼2009-01-06 18:53:43

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hakuna

木虫 (知名作家)

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★ ★
mingdong(金币+2):O(∩_∩)O谢谢！ 2-2 14:48

1.NEB需要并行编译
2.Henkelmann的模块只要按说明编进去并按说明设定一些开关参数，使用应没问题，建议检查一下你的参数设置。
3.中间各IMAGE的POSCAR是否给了？如果你做过NEB，似乎不应该是这个问题。
4.加入HENKELMANN的模块应该不会明显影响其他计算速度，比较吸附结构优化快慢要在相同条件下进行。

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2楼2009-02-01 18:59:34

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huangyc

木虫 (正式写手)

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★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流！ 2-27 21:21

谢谢hakuna。这个问题当时是由于编译出来的是串行的VASP，所以不能用NEB，当然吸附作业也很慢。
后来我编通了加入HENKELMANN模块的VASP，但是我用DIMER试着计算H在Ir表面的吸附时结果与其给出的结果差异很大！
This is my DIMCAR:
Step Force Torque Energy Curvature Angle
1 6.00303 62.54346 -43.65348 -4.35175 51.96997
1 6.00303 29.66141 -43.65348 -30.30397 28.72234
1 6.00303 43.47671 -43.65348 -29.62354 22.03665
1 6.00303 43.95336 -43.65348 -36.35973 32.77807
2 5.96294 62.10673 -42.93899 7.41361 47.81462
2 5.96294 41.27629 -42.93899 -0.21401 50.02325
2 5.96294 52.04768 -42.93899 -15.22481 63.97874
2 5.96294 30.37417 -42.93899 -45.71445 47.09034
3 9.29362 50.33743 -42.11095 -39.44532 39.66616
3 9.29362 49.35017 -42.11095 -46.38845 15.85466
3 9.29362 37.96595 -42.11095 -19.45687 16.87820
3 9.29362 63.88947 -42.11095 -9.39955 29.57697
4 6.63616 55.00641 -42.72418 -13.63088 49.31484
4 6.63616 47.34260 -42.72418 -20.79042 53.31710
4 6.63616 44.61408 -42.72418 -7.00383 36.38111
4 6.63616 52.42354 -42.72418 -29.27678 40.73667
5 6.12472 58.14640 -42.90530 16.37393 49.95035
5 6.12472 27.44705 -42.90530 -39.67825 45.06249
5 6.12472 28.63904 -42.90530 -46.47566 43.13384
5 6.12472 37.36798 -42.90530 -35.21709 28.73560
6 8.41172 85.36661 -42.25029 54.46575 51.26931
6 8.41172 53.50163 -42.25029 9.50417 51.54881
6 8.41172 39.19520 -42.25029 -17.23088 55.37392
6 8.41172 15.99630 -42.25029 -2.68529 37.49634
7 7.06283 82.18965 -42.79868 -46.79451 43.00328
7 7.06283 19.18125 -42.79868 -43.55311 10.04628
7 7.06283 25.02933 -42.79868 -65.14327 18.95049
7 7.06283 25.48192 -42.79868 -38.12766 8.81324
8 5.14574 24.66614 -43.19446 34.59774 53.52603
8 5.14574 41.57356 -43.19446 -26.00020 45.50149
8 5.14574 18.81300 -43.19446 -42.94956 44.32579
( I killed it)
This is DIMCAR from VASP tools' website
Step Force Torque Energy Curvature Angle
1 3.26055 1.42551 -38.08043 -3.67928 7.32459
1 3.26055 0.47200 -38.08043 -3.89665 0.48560
2 0.65134 0.32662 -38.17792 -2.88463 1.05846
3 0.18678 0.22588 -38.19421 -2.88144 0.23646
4 0.20597 0.11406 -38.19315 -2.82977 0.14029
5 0.02071 0.58961 -38.19131 -3.08022 0.61217
6 0.01329 0.06599 -38.19131 -3.05717 0.14982
7 0.00990 0.11718 -38.19130 -3.07347 0.26844
8 0.00208 0.11183 -38.19130 -3.04074 0.14479
真诚希望与你交流，谢谢

[ Last edited by huangyc on 2009-2-15 at 15:09 ]

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3楼2009-02-15 15:08:20

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