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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 用Bader 做电荷分析，得到的总电子数后面有小数点
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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhangfrank at 2017-05-02 19:33:24
因为有数值处理误差。没有关系的。
2楼回复的很好

多谢回复。我处理之后得到的ACF.dat 文件最后显示的 NUMBER OF ELECTRONS : 957.92 那这样虽然也很接近958，但依然是有小数点。因为数据处理有误差的话，那这个结果是OK的。
现在还有一个小问题，想请教下您的看法。我之前用的 NGXF NGYF NGZF 分别为160 168 224，　ACF 文件总电子数957.92, 然后继续分析了吸附小分子的总电荷为33.81 (理论总电荷为34)，　这样看的话在吸附模型中失去0.19的电荷；当我把NGXF NGYF NGZF 提高为两倍，即为320 336 448，ACF文件里总电子数957.94，这个时候我再去分析这个吸附小分子的总电荷为34.15 ，这样又变成了得到0.15的电荷。这样哪个更可信呢？我主要是想要分析一下这个吸附分子是得到还是失去电子，这样相反的结果让我很疑惑。还是说我要继续增大NGXF 呢？320 336 448 已近很大了，可否谈谈您的看法
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11楼2017-05-05 17:14:47
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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by SB25000 at 2017-05-05 17:14:42
ENCUT取的多少？

ENCUT 取的500 , 和之前优化结构的时候取得一样的，没有改变。
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12楼2017-05-05 17:16:54
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zhangfrank

金虫 (正式写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 抖抖豆豆 at 2017-05-05 17:14:47
多谢回复。我处理之后得到的ACF.dat 文件最后显示的 NUMBER OF ELECTRONS : 957.92 那这样虽然也很接近958，但依然是有小数点。因为数据处理有误差的话，那这个结果是OK的。
现在还有一个小问题，想请教下您的看法 ...

我觉得，如果是你想看这个吸附分子（比如是一个H2O分子为例子）你最好是看这俩H1个O原子上的电荷在吸附后是多少，再算单独的H2O的bader电荷做差值再加和。比你看整个体系的电荷变化来得好一些。
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计算顺利点吧
13楼2017-05-05 17:25:47
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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by zhangfrank at 2017-05-05 17:25:47
我觉得，如果是你想看这个吸附分子（比如是一个H2O分子为例子）你最好是看这俩H1个O原子上的电荷在吸附后是多少，再算单独的H2O的bader电荷做差值再加和。比你看整个体系的电荷变化来得好一些。...

我理解是：吸附后的分子我分析之后可以得到每个原子的电荷，对于吸附分子单独做电荷分析，把这两种作一个对比，，去比较得失电子。这样理解你的意思是对的吧？
因为我之前都是拿吸附后的电荷分析和这个吸附分子按照价电子得到的理论总电荷做比较的。
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14楼2017-05-05 17:39:07
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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)
再来刷一下帖子
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15楼2017-05-08 21:07:37
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yonghao_zhu

新虫 (初入文坛)
楼主，你每个原子上的charge求和等于number of electrons吗？能否把你的INCAR文件发出来看一下？
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16楼2017-06-04 10:32:21
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