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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 系统发育树
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奔腾的小马达

木虫 (正式写手)

[求助] 系统发育树 已有1人参与

请教各位朋友们，我MEGA 5 做的系统发育树树上的同源性数值太低，但是我在NCBI上下载的序列同源性都是非常高的。请问这是什么情况 啊？急求，谢谢各位亲啦！！！

系统发育树
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努力才能得到！
1楼 2017-04-29 20:52:57
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曲水流

新虫 (正式写手)
可能序列本身差异就小，所以误差就大

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2楼2017-04-30 09:06:33
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曲水流

新虫 (正式写手)
你这是真菌18srDNA啊

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3楼2017-04-30 09:07:07
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wlm0917

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
很正常啊，你要在那些相似度高的里面继续找，而不是随便选几个
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4楼2017-05-01 20:30:00
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闷葫芦同学

新虫 (初入文坛)
首先选择大量的同源序列，预构建一个系统发育树，比对次数选择1000,从图中删除分支较远的误解，重新建树一直到分支点数值增大到何时值

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5楼2017-05-01 23:01:34
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江云儿小郭郭

银虫 (正式写手)
现在都用mega7了

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6楼2017-05-01 23:56:23
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lusandanooo

银虫 (小有名气)
5楼正解。不知道你做系统发育树是要鉴定菌种还是干嘛，鉴定菌种的话跟看跟它聚在一支的就行了，16S能鉴定到属，要定还要种得做其他分析。另外，你多序列比对、建树用的什么方法，检测的时候参数怎么选的，你都没有说.......
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毕了业真开心嘻嘻嘻嘻嘻
7楼2017-05-02 11:10:24
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