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guoxingjun2008

金虫 (正式写手)

[交流] 如何在Genbank上寻找编号的序列??

我在文献中看到这样一句话:根据GeneBank发表的植物防御素同源序列
AF32668来设计引物,我想查到AF32668看看,但是怎么查都查不出来,输入这个编号不行,输入防御素的英文名也不行。

  还有一篇文献是这样讲的:参照GenBank中的ALDH 基因(AB106869 ) 及Tcr
基因( J01749)来设计引物,这个ALDH和Tcr基因又怎么查?

会使用的朋友能不能赐教一下呀,谢谢!!

[ Last edited by guoxingjun2008 on 2009-1-6 at 11:28 ]
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gastrodia

金虫 (正式写手)

进入genebank的主页,选择nucleotide,搜索AB106869和J01749,就会有结果了,那个AF32668,你可能搞错了吧,在all databases中都搜不到的。
2楼2009-01-06 11:47:58
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guoxingjun2008

金虫 (正式写手)

谢谢你,但是文献上面就是这样写的呀
3楼2009-01-07 00:56:01
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guoxingjun2008

金虫 (正式写手)

还有一个问题就是,我有的时候查看一个序列,明明它后面写的RNA,但是最后给的序列中这么会出现t呀,例如:
   LOCUS    NR_024156       4929 bp    RNA     linear   PRI 04-JAN-2009
DEFINITION  Homo sapiens spleen tyrosine kinase (SYK), transcript variant 4,
            transcribed RNA.
ACCESSION   NR_024156
VERSION     NR_024156.1  GI:205277438
KEYWORDS    .
SOURCE      Homo sapiens (human)
ORIGIN      
        1 gactttctgg taaggagagg aggttacggg gaacgacgcg ctgctttcat gccctttctt
       61 gttctacctt catcggccga ggtggacacc tgcgcaggtg tgtgccctcc ggcccctgaa
      121 gcatggccag cagcggcatg gctgacagcg ccaaccacct gcccttcttt ttcggcaaca
      181 tcacccggga ggaggcagaa gattacctgg tccagggggg catgagtgat gggctttatt
      241 tgctgcgcca gagccgcaac tacctgggtg gcttcgccct gtccgtggcc cacgggagga
      301 aggcacacca ctacaccatc gagcgggagc tgaatggcac ctacgccatc gccggtggca
      361 ggacccatgc cagccccgcc gacctctgcc actaccactc ccaggagtct gatggcctgg
      421 tctgcctcct caagaagccc ttcaaccggc cccaaggggt gcagcccaag actgggccct
      481 ttgaggattt gaaggaaaac ctcatcaggg aatatgtgaa gcagacatgg aacctgcagg
      541 gtcaggctct ggagcaggcc atcatcagtc agaagcctca gctggagaag ctgatcgcta
      601 ccacagccca tgaaaaaatg ccttggttcc atggaaaaat ctctcgggaa gaatctgagc
   上面 那个编号后面有该序列的大小,而且标明是RNA呀,怎么会出现胸腺嘧啶T呀?
4楼2009-01-07 01:02:20
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nnxqwei

至尊木虫 (职业作家)

GenBank还是有很多人写成GeneBank,我在论坛里提了多次了。。。。
5楼2009-01-07 03:52:00
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