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如何快速读取POSCAR层间距已有1人参与
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如题 因为算表面能的时候需要测试不同层数的收敛性 手动操作比较费时 想请教是否有方法快速读取并按顺序写出每一层的z值（或者直接给出层间距也可以） 发自小木虫IOS客户端 |
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yangych0801
木虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 2448.4
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- 虫号: 1325314
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- 专业: 细胞生长与分裂
2楼2017-05-03 12:05:23
【答案】应助回帖
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涂云(漫天飘雪代发): 金币+10, 谢谢交流 2017-05-06 21:20:59
涂云(漫天飘雪代发): 金币+10, 谢谢交流 2017-05-06 21:20:59
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快速读取并按顺序写出每一层的z值 1. 把 POSCAR 拿出?� (或 CONTCAR) Direct 這行以上的東西都刪掉 (包括 Direct 這行) 最後一顆原子以下的數據也全都刪掉 確定行與行之間沒有空行 把這個編好的 POSCAR 另存新檔 (比方~ aaaa) 2. 用 linux 指令去處理這個被編輯過後的檔 aaaa 指令為 sort -n -k 3 aaaa 此時畫面就會顯示出 排序後 的原子位置 sort: 排序 -n: 表示~ 被排序的東西是個 number -k 3: 表示~ 被排序的東西是在第三欄 (也就是 z position) 3. 若是原子很多~ 可以用 sort -n -k 3 aaaa > bbbb 把結果存到 bbbb 4. sort 排序會?男∨诺酱螅羰窍胍�?拇笈诺叫。� -r sort -r -n -k 3 aaaa |
3楼2017-05-04 23:22:18
4楼2017-05-06 20:49:06