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xuehu2008铜虫 (正式写手)
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帮忙看看我的脉冲长凝胶电泳
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再做大肠杆菌的紫外损伤，在其形成嘧啶二聚体后用T4DNA内切酶V切割，可形成单链nick，想用脉冲场电泳分析辐照前后基因组由于酶切造成构型不同从而呈现的差异，但问题是脉冲电泳做了好几次，都发现只在凝胶最下面有一团。今天用普通琼脂糖电泳跑了一下，还是得到相似的结果。（见附件：第一幅为脉冲电泳结果，第二幅为普通电泳结果） 问题如下： 1.环状的基因组和由于酶切造成的ocDNA通过脉冲场能找出差异吗？有没有哪位做过？开始怀疑实验的设计了。 2.按理说不加脉冲的话用普通琼脂糖电泳是不可能跑大肠杆菌基因组的，因为4M大小的分子不可能挤过凝胶孔隙。那为什么从扫胶结果看反而跑在了200bp大小的位置？ |
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