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用modeltest得到的最佳模型后如何在Mrbayes设置block来构树
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请教各位高手，我用modeltest得到的最佳模型是TVM+I+G，请问我如何在Mrbayes设置block来构树？急用，万分谢谢！！！ modeltest的结果如下： Model selected: TVM+I+G -lnL = 1686.4208 K = 9 Base frequencies: freqA = 0.2106 freqC = 0.2002 freqG = 0.0403 freqT = 0.5489 Substitution model: Rate matrix R [A-C] = 1.2035 R [A-G] = 15.8609 R [A-T] = 1.2200 R [C-G] = 0.0000 R [C-T] = 15.8609 R [G-T] = 1.0000 Among-site rate variation Proportion of invariable sites = 0.3078 Variable sites (G) Gamma distribution shape parameter = 0.6529 -- PAUP* Commands Block: If you want to implement the previous estimates as likelihod settings in PAUP*, attach the next block of commands after the data in your PAUP file: [! Likelihood settings from best-fit model (TVM+I+G) selected by hLRT in Modeltest 3.7 on Mon Sep 29 16:47:08 2008 ] BEGIN PAUP; Lset Base=(0.2106 0.2002 0.0403) Nst=6 Rmat=(1.2035 15.8609 1.2200 0.0000 15.8609) Rates=gamma Shape=0.6529 Pinvar=0.3078; END; |
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