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水和石墨烯驰豫
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units real dimension 3 boundary p p p atom_style full #read topology read_data waterge1.data #force-field parameters #c=1,o=2 h=3 pair_style lj/cut/coul/cut 10.0 bond_style harmonic angle_style hybrid charmm harmonic dihedral_style charmm special_bonds lj/coul 0.0 0.0 0.0 pair_coeff 1 1 0.086 3.4 bond_coeff 2 305.0 1.4 angle_coeff 1 charmm 40.000 120.0 35.00 2.41620 dihedral_coeff 1 3.100 2 180 0.0 #tip3 water 0=2,h=3 pair_coeff 3 3 0.1020 3.1880 #modified 0.1521 3.1507 pair_coeff 2 2 0.0460 0.4000 pair_coeff 2 3 0.0836 1.7753 bond_coeff 1 450 0.9572 angle_corff 2 harmonic 55 104.52 #water-cnt interactions #hydrophbic #pair_coeff 1 2*3 0.646 3.4138 #hydrophilic pair_coeff 1 2*3 0.1143 3.2751 neighbor 2.0 bin neigh_modify delay 0 every 1 check yes exclude type 1 3 #output thermo 1000 thermo_style multi dump 22 all dcd 1000 project.dcd timestep 2.0 group water type 2 3 group cnt type 1 #equilibration velocity water creat 300.0 4928459 rot yes dist gaussian fix 1 cnt setforce 0.0 0.0 0.0 fix 2 all nvt temp 300.0 300.0 100.0 dump 3 all atom 100 CNTW.lammpstrj run 10000  发自小木虫Android客户端 |
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