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解离能怎么做 已有2人参与
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我在做一个HgX2(x是卤素)的解离能 不太清楚具体怎么用高斯来计算 已经做了分子的opt+freq 接下来是不是分成片段Hg+X2来opt+freq然后再算前后的能差呢 求各位前辈大神教教我 都困扰了好几天 网上也没看到别人具体怎么做的 发自小木虫Android客户端 |
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paramecium86
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
scfslyzkf: 金币+5, 应助指数+1, 很详细，学习了 2017-04-19 15:01:23
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conventional解离能可以直接opt算出complex的能量 和每一个monomer的能量 然后用楼上楼上给的公式BDE=E(complex)-E(monomer1)-E(monomer2)。 也可以考虑BSSE并且用counterpoise方法进行校正。 关键词就是counterpoise input写法大概就是 # B3LYP/SDD Counterpoise=2 NoSymm Opt HgX + X, optimization with counterpoise correction using ECP basis 0 1 0 2 0 2 ! charge and multiplicity for complex, monomer1, and monomer 2， respectively Hg(Fragment=1) 0.00000000 0.00000000 2.000 X(Fragment=1) 0.00000000 0.00000000 1.000 X(Fragment=2) 0.00000000 0.00000000 3.000 正常算完的话找到输出文件里面类似这样的话 Counterpoise corrected energy = xxxxx BSSE energy = xxxxx sum of fragments = xxxxxx complexation energy = xxxxx kcal/mole (raw) complexation energy = xxxxx kcal/mole (corrected) 基本上就能得到解离能了 |
4楼2017-04-19 03:13:43
2楼2017-04-18 16:04:05
3楼2017-04-18 20:07:49
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太感谢了 这个真的特详细 我还在sob的帖子里看到另一种感觉是不同的方法 先算整个分子HgX2的能量 然后减去Hg原子个X2分子的单点能 完了后两者想加减分子能量再加上热化学修正的量 这样算是不是也可以 那两种方法哪种的更可靠呢 发自小木虫Android客户端 |
5楼2017-04-19 09:53:52
paramecium86
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零点校正 是应该加进去的 既然分解前后振动差距很大。做法就是 分别opt freq complex和两个monomer 得到零点校正以后的能量(zero-point corrected energy) 然后再用公式BDE=E(complex_corr)-E(mono1_corr)-E(mono2_corr)就可以了.这个和BSSE校正是不同类型的校正 BSSE校正主要是修正计算中人为加入的误差 发自小木虫IOS客户端 |
6楼2017-04-19 10:28:55
7楼2017-04-19 10:41:33
scfslyzkf
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8楼2017-04-19 15:00:32
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9楼2017-04-19 15:01:39
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10楼2017-04-19 15:01:42
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