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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 动植物 » 实验技术 » CDS区是间断的，如何设计引物？
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GOODGUN

新虫 (初入文坛)

[求助] CDS区是间断的，如何设计引物？ 已有1人参与

CDS             join(146..242,460..641,1167..1253,1821..1946,2068..2130,
                     2768..2917,3107..3174,3535..3646,3787..3891,4023..4144,
                     4308..4454,5046..5214)
NCBI上的CDS区是这个样子，怎么设计引物？望各位哥哥姐姐伸手援助啊
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大家好，我是GOODGUN，多交流。
1楼 2017-04-16 15:42:11
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sxjcas

禁虫 (知名作家)
本帖内容被屏蔽
4楼2017-04-18 22:59:32
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malstose

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引物序列直接落在CDS区域（就20nts左右的碱基）就可以了吧~，扩增基因的话要以RNA为模版。
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2楼2017-04-17 15:37:08
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GOODGUN

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by malstose at 2017-04-17 15:37:08
引物序列直接落在CDS区域（就20nts左右的碱基）就可以了吧~，扩增基因的话要以RNA为模版。

嗯嗯，主要是设计来做定量的。那么以cDNA为模板的话，引物是不是最好要跨两个外显子？在用PP5设计引物的时候，向我上边这样的间断的CDS区是不是要先给它手动拼接起来，再复制导PP5内进行设计？
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大家好，我是GOODGUN，多交流。
3楼2017-04-18 21:07:39
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