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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS导入晶体结构文件之后对称性显示与初始结构不同
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源鹭

新虫 (小有名气)

[求助] MS导入晶体结构文件之后对称性显示与初始结构不同 已有1人参与

晶体结构文件，其对称性是P1, 但是在导入MS之后，查看晶体对称性，其显示为 目前非P1, symmetry is changed: was P1. 但是在操作面板上删除原子，又可以看出其原子是没有对称性的，请问，这是怎么回事呢？

MS导入晶体结构文件之后对称性显示与初始结构不同
MS_find symmetry.png


MS导入晶体结构文件之后对称性显示与初始结构不同-1
晶体cif结构对称性.png
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不念过去，不畏将来
1楼 2017-04-13 08:35:59
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
源鹭: 金币+15, ★有帮助, 谢谢啦！ 2017-04-15 09:41:14
cif文件直接导入MS时，空间群可能会发生变化，这是很常见的问题。
以cif中的空间群为准，导入MS后，在MS中--build--crystals--rebuild crystal 把空间群改成cif中给出的那样即可。
通过cif文件直接导入MS建模后，在properites中检查lattice 3D中的各参数与cif中的一致性，这是保证建模正确的基本步骤。
赞一下 回复此楼
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
2楼2017-04-13 09:59:06
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源鹭

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2017-04-13 09:59:06
cif文件直接导入MS时，空间群可能会发生变化，这是很常见的问题。
以cif中的空间群为准，导入MS后，在MS中--build--crystals--rebuild crystal 把空间群改成cif中给出的那样即可。
通过cif文件直接导入MS建模后， ...

谢谢楼上热心应答。我现在明白问题出在哪里了，ms的find symmetry并不是现有的对称性，其实这个结构导入ms之后也是没有对称性的。

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不念过去，不畏将来
3楼2017-04-13 23:43:31
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fuchonglong

新虫 (初入文坛)
。。P1不就是没有对称性么。。？

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4楼2017-05-05 12:58:34
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