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xixi1007

木虫 (小有名气)

[交流] gaussian计算非谐性出错Error: segmentation violation,

我用选模的方法计算一个分子的非谐性,结果老是出错是怎么回事。log文件最后显示如下:
Vib (V=0)   94  0.106591D+01          0.027721          0.063831
Vib (V=0)   95  0.106591D+01          0.027721          0.063831
Vib (V=0)   96  0.106432D+01          0.027072          0.062336
Vib (V=0)   97  0.106432D+01          0.027072          0.062336
Vib (V=0)   98  0.105807D+01          0.024513          0.056442
Vib (V=0)   99  0.105756D+01          0.024304          0.055961
Vib (V=0)  100  0.105738D+01          0.024229          0.055790
Electronic      0.100000D+01          0.000000          0.000000
Translational   0.657817D+09          8.818105         20.304437
Rotational      0.186664D+08          7.271061         16.742237
AtmSel:  Line="223-228"
AtmSel:  NamVal=Modes NAtLst=     0 NIVal=     6 NNoVal=     0:
AtmSel:    IVal=    223    224    225    226    227    228
NorSel:  MapVib=    223    224    225    226    227    228

pbs.err文件显示
Error: segmentation violation, address not mapped to object
   rax 732c7261686e6128, rbx 00002ab2117f19f0, rcx 3fefffffa0234c5a
   rdx 00002ab2118942f0, rsp 00007fffadd732f0, rbp 00007fffadd732f0
   rsi 00007fffadd743f0, rdi 00002ab5106ee010, r8  0000000000000000
   r9  3feffffffffffffa, r10 0000000000000118, r11 0000000000000002
   r12 00002ab2117f19f0, r13 bfeffffffffff688, r14 00007fffadd743f0
   r15 00007fffadd743f0
  0  0x589961  iarmax_ + 0x151
  1  0x50e640  dgnsum_ + 0x90
  2  0x4c934a  vibtbl_ + 0x6ea
  3  0x4c8aed  vibsym_ + 0x2ed
  4  0x4c7f7d  vibmw_ + 0x105d
  5  0xbfefffffffffff6d
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ra2ghgzh

木虫 (正式写手)

学痴

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
xixi1007: 金币+2 2017-04-17 10:34:24
非谐性计算对资源的占用很大,你可以降低基组大小再试试。
我永远当不了老板
2楼2017-04-12 16:19:20
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xixi1007

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ra2ghgzh at 2017-04-12 16:19:20
非谐性计算对资源的占用很大,你可以降低基组大小再试试。

我的基组已经很小了,是b3lyp/6-31g(d)
3楼2017-04-17 10:34:10
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Yan_Jordan

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
xixi1007: 金币+2, 谢谢,我的内存已经很大了,14GB应该可以了。 2017-05-13 11:27:54
Error: segmentation violation 一般读写非授权内存区域。

既然一开始的时候已经做了一部分计算了,那说明你的文件夹权限没问题,只能是你定义的内存太小了,需要你增加内存。或者如2楼说的,减小基组。
4楼2017-04-17 20:10:34
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祝福
5楼2017-04-17 20:27:08
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