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znn19900505

铜虫 (小有名气)

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[交流] CHIP实验咨询！已有1人参与

CHIP实验咨询！第一次做CHIP的实验，已经做完DNA Purification这一步，在跑Q-PCR之前，特地先用NanoDrop测了一下最后sample里面的DNA浓度，结果测出的DNA浓度很低 IP组第一次测才几ng/ul 又将Eluent加热到65度重新洗脱了一下又测了两次都是300-400 ng/ul 但input组（control）测了几次都是几十ng/ul 而且260/280也很低 1.5左右！想问一下，CHIP实验最后的DNA浓度一般都是多少才可以跑qRT-PCR？得到的DNA浓度和纯度都很低很可能是哪些原因造成的？怎么避免这种情况？请做过的大神指教一下！谢谢，感激不尽！

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1楼 2017-04-11 10:09:34

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airbus320

禁虫 (小有名气)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

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2楼2017-04-11 11:21:33

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znn19900505

铜虫 (小有名气)

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引用回帖:

2楼: Originally posted by airbus320 at 2017-04-11 11:21:33
IP用的啥抗体？一般到不了几百ng/ul。组蛋白抗体(不针对特别修饰的)一般才数十ng/ul。
Input也还正常。

一般不测浓度，毫无意义。选用正对照区域做qPCR，选择非结合区作为负对照。

您是做过这方面的实验吗？您说的：选用正对照区域做qPCR，选择非结合区作为负对照。这个我不是很理解，请指点！