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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【有奖求助】：MS模拟中的形成能问题 50金币
汕头大学海洋科学接受调剂
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心宁

金虫 (正式写手)

[交流] 【有奖求助】：MS模拟中的形成能问题 50金币

我遇到一些关于计算形成能的问题:建立结构后 掺杂 如何计算缺陷的形成能、得到缺陷能级呢？

我会一些 但不知道如何确定一些原子的化学势

谢谢虫友的相告 如果是南京的虫友 我登门请教 请喝茶或者赠你最喜欢的一本专业书

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-21 at 16:38 ]
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志存高远须积厚流广－坚持不懈定斗转星移！
1楼 2009-01-01 12:46:41
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

css8170

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
wuchenwf(金币+3,VIP+0):谢谢 O(∩_∩)O
楼上说的有道理，化学势的计算有时要根据具体的环境来设置，如H的化学势，既可能是与H2 平衡时的化学势，也可能是与H2O平衡时的化学势，另外掺杂原子的价态也需要考虑。
    这是一个很有意义的话题，建议斑竹组织一个专门的讨论。
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15楼2009-01-03 23:02:18
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普通回帖

q68

铁杆木虫 (著名写手)
这个问题我也一直想知道！
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2楼2009-01-01 12:58:33
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effi903

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★
wuchenwf(金币+2,VIP+0):谢谢，新年快乐
心宁(金币+1,VIP+0):新年快乐 敬请继续说明
形成能=掺杂后体系的总能量-掺杂前体系的总能量-掺杂的原子能量+被替代的原子的能量。掺杂的原子能量和被替代的原子的能量是体结构中单个原子的能量。
新年快乐！
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3楼2009-01-01 13:06:38
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q68

铁杆木虫 (著名写手)
★
wuchenwf(金币+1,VIP+0):xiexie
这个道理都知道，但是遇到具体的情况，比如晶格优化是怎么设置等这才是重点！
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4楼2009-01-01 13:22:22
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心宁

金虫 (正式写手)
希望回答的要说正题： 比如如何分析 potential 如何知道具体原子的化学势。。。。

请问2L 如何求得 体结构中单个原子的能量

谢谢



PS 不要把我的金币送给灌水的 不然我会要回来的哈

[ Last edited by 心宁 on 2009-1-1 at 16:56 ]
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志存高远须积厚流广－坚持不懈定斗转星移！
5楼2009-01-01 16:54:57
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css8170

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
jghe(金币+1,VIP+0):感谢你参与讨论！
心宁(金币+10,VIP+0):该立方体就包含我需要的一个原子 不包含任何其他的原子 对吗？ 如果要是气体怎么办呢？如氧气。。
fegg7502(金币+2,VIP+0):Happy new year, you are welcome!
将单个原子放在一个较大的立方晶格中，如20A*20A*20A的晶格中，计算ENERGY就可以获得该原子的能量。
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6楼2009-01-01 22:20:05
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心宁

金虫 (正式写手)

谢谢LS

你在南京不？  能告诉我你的QQ 或者实验室电话吗？  
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志存高远须积厚流广－坚持不懈定斗转星移！
7楼2009-01-01 23:13:41
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css8170

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
心宁(金币+8,VIP+0):谢谢
我不在南京，如果是O2，可将O2分子放在同样的晶格中来计算，获得的能量值再除以2。
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8楼2009-01-01 23:22:18
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cos60

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
心宁(金币+1,VIP+0):谢谢 希望各位大牛 都来说说 呵呵
zdhlover(金币+5,VIP+0):非常感谢详细指点！！
心宁(金币+7,VIP+0):请问如何知道 Si 游离态原子的能量呢 ？
斗胆据个例子，不当之处还要牛人指正。
举例：以MS中CASTEP中计算Si中掺杂B的形成能。
1、建立超晶胞，建立host Si，计算总能
打开晶体结构Si，建立一个64原子的超晶胞，优化后，计算总能，然后减去64个游离态原子的总能量，这个是host的结合能，记为E(host)。记u(Si)=E(host)/64,此为Si的化学势。
2、掺杂的超晶胞，计算总能
在优化好的Si x64中用一个B代替Si，优化好后，计算总能，然后减去63个游离态Si原子和B原子的总能量，这是有缺陷晶体的结合能，记为E(B，0).
3、计算B的化学势
B常见的结构是六角结构的，所以建立一个含有n个B原子的超晶胞，优化好后，计算总能，再减去然n个B的原子能量，再除以原子数n，这是B的化学势，记为u (B).
4、形成能计算
形成能Ef=E(B,0)-E(host)+u(Si)-u(B)
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9楼2009-01-02 00:48:39
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vegalew

金虫 (小有名气)
★
jghe(金币+1,VIP+0):感谢你参与讨论！
2楼说的很准确啦，我再给你提供几个文献看看吧
PHYSICAL REVIEW B 74, 233201 （2006）
Chemical Physics Letters 458 (2008) 341–345

细节多看看manual就知道了。无非就是建立不同的结构优化了能量加加减减就好了
然后分析分析DoS，做个pDoS看看在价带顶和导带底掺杂原子贡献了什么
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10楼2009-01-02 00:51:12
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