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初学者关于MS中吸附初始构型的角度问题，求助 已有1人参与
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本科初次接触MS，要计算噻吩在Ni111晶面的吸附，故打算对着文献用MS搭建初始吸附构型练习一下。 我看的文献给出的初始构型是这样的：  里面提到 0 和 45 分别代表平行于平面轴线方向和与轴线成 45 度角的方向。 现在我想试着搭建BRI-0，TOP-0，HOL-0三个初始吸附结构，然而我建立的晶胞是菱形的，感觉搭建出来的结构有问题，尤其是HOL-0位，我就是简单的保持角度不变平移了位置，感觉有问题。 希望大家帮帮看一下。另一个问题是，菱形晶胞中BRI-45是把BRI-0旋转45度吗 下图为我自己搭建的：  大家看看有什么错误没有。 论坛新人，全部家当只有十个金币，万望海涵。 |
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