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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 初学者关于MS中吸附初始构型的角度问题，求助
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septtm

新虫 (初入文坛)

[求助] 初学者关于MS中吸附初始构型的角度问题，求助 已有1人参与

本科初次接触MS，要计算噻吩在Ni111晶面的吸附，故打算对着文献用MS搭建初始吸附构型练习一下。
我看的文献给出的初始构型是这样的：初学者关于MS中吸附初始构型的角度问题，求助
里面提到 0 和 45 分别代表平行于平面轴线方向和与轴线成 45 度角的方向。
现在我想试着搭建BRI-0，TOP-0，HOL-0三个初始吸附结构，然而我建立的晶胞是菱形的，感觉搭建出来的结构有问题，尤其是HOL-0位，我就是简单的保持角度不变平移了位置，感觉有问题。
希望大家帮帮看一下。另一个问题是，菱形晶胞中BRI-45是把BRI-0旋转45度吗
下图为我自己搭建的：
初学者关于MS中吸附初始构型的角度问题，求助-1
大家看看有什么错误没有。
论坛新人，全部家当只有十个金币，万望海涵。
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1楼 2017-04-05 15:30:44
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whyaquarius

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
septtm(蛋蛋小童鞋代发): 金币+1, 谢谢参与，小木虫鼓励积极回答问题者 2017-04-06 17:12:40
我感觉你可能是对参考文献的理解有偏差，正常情况下fcc结构的Ni 111面的晶格显然不应该是方形的，而是长方形的。或者说是菱形的，也就是说跟你自己画出来的一样。

至于文献上为什么会弄出来正方形的Ni 111 面晶格分布，估计还得从原始文献里找答案。
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2楼2017-04-06 14:51:18
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李乐乐5546

新虫 (初入文坛)
请教一下，算Ni催化裂解CH4，结构优化时，Ni表面会发生原子错位的情况~看你也算过Ni，冒昧请教一下不知道你在计算过程中有没有遇到过类似情况？该怎么解决呀
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3楼2017-04-06 21:53:51
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