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yijiaobani

铜虫 (小有名气)

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专业: 植物遗传学

[交流] 文献：遗传参数评估的计算方法已有1人参与

PS，小木虫什么时间支持markdown啊，或者正常编辑器也行啊，我可以用markdown转化。

现在，看图模式：

正文为markdown格式：
> 王庆志, 李琪, 刘世凯,等. 长牡蛎成体生长性状的遗传参数估计[J]. 中国水产科学, 2012, 19(4):700-706.

# 摘要
> * 测量性状：
在长牡蛎( Crassostrea gigas)的选择育种工作中,于2009年和2010年分别获得24个和32个全同胞家系.根据长牡蛎360日龄的壳高、壳长、壳宽、总重、壳重、肉重和出肉率参数,利用**ASREML软件**的REML方法计算表型变量的方差组分,估算r长牡蛎成体阶段生长性状的**遗传参数**.
* 结果
不同年份长牡蛎家系的生长存在显著差异,2009年家系的壳高、肉重和出肉率显著低于2010年家系(p＜0.05)，2009年家系的总重则显著高于2010家系 (P＜0.05)。除出肉率外,2009年和2010年家系的壳高与其他生长性状均存在显著的正相关性（P＜0.05）。
壳高和总重具有较高的遗传力, 分别为0.35±0.15和0.27±0.13.
长牡蛎成体阶段各生长性状间的**遗传相关和表型相关**均为正相关,但相关性的大小不同.
本研究估测的长牡蛎成体阶段生长性状的遗传参数,可以为合理制定长牡蛎的育种方案和选择反应预测提供参考依据.

# 试验设计
> 实验所用的长牡蛎亲本为未经选育的威海本地养殖群体。分别于2008 年6 月和2009 年6 月选取性腺发育成熟、性状优良的个体为亲本, 采用解剖法辨别雌雄后采集精卵, 将适量精卵混合进行授精。采用Comstock 等设计的巢式交配设计,每个雄性牡蛎分别与1~3 个雌性牡蛎交配。2008年共构建全同胞家系36 个, 2009 年生长至成贝时获得全同胞家系24 个。2009 年共构建全同胞家系54 个, 2010 生长至成贝时获得全同胞家系32 个。

# 数据分析模型
**回归分析**
> 以壳高为自变量, 其他性状为应变量, 分别作最小二乘法的简单线性回归。
这个是简单的线性回归，对应的程序：
```
model <- lm(y ~ x, data=dat);summary(model)
```
**方差分析**
> 用单因素方差分析(ANOVA)比较性状在不同年份的差异、壳高与其他生长性状间相关性在不同年份的差异。
```
model <- aov(y ~ year, data = dat); summary(model)
```
**动物模型**
> 根据所获得的数据, 建立单性状无重复观测值的动物模型, 构建模型如下:
Yijk = μ + Aijk+ Eij + eijk
其中, Yijk 为性状观测值, μ 表示总体均值, Aijk 为随机遗传效应; Eij 为随机共同环境效应; eijk 为随机残差。采用ASREML 软件中的约束极大似然法进行遗传参数的估计。

采用**asreml软件**进行动物模型的分析

# 结果
**汇总统计**

![](http://upload-images.jianshu.io/ ... mageView2/2/w/1240)

**回归分析**

![](http://upload-images.jianshu.io/ ... mageView2/2/w/1240)

**遗传相关和表型相关**

![](http://upload-images.jianshu.io/ ... mageView2/2/w/1240)

遗传参数是制定育种方案的参考依据, 当某一性状的遗传力较高时可以采用群体选育方法进行选育, 而当遗传力较低时则可以通过家系选育等方法进行间接地选育。

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