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呆呆小宙斯

铜虫 (初入文坛)

[求助] shannon指数的问题 已有2人参与

关于shannon指数的一些问题求教一下大家:
在高通量测序的时候,不同论文的shannon指数可不可以进行比较呢?比如两个环境的shannon指数,可不可以说shannon指数大的那个环境微生物多样性更为丰富?

@biostar2009 @youlinglyw @wizardfan @飞约疯人院 发自小木虫Android客户端
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敖潇

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
个人觉得可以进行对比,因为他们是用同一个公式计算得出的微生物多样性。不同的采样点,可以进行比较,不同的论文也就相当于不同的采样点,同样可以进行比较。
2楼2017-03-23 14:35:16
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小马科研部落

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

看一下用哪种方法来算的吧。我试过,用Mothur和R语言计算的shannon和simpson指数,不一样。
更多内容,请关注微信公众号【小马科研部落】,有问题可找QQ308091253
3楼2017-09-14 16:26:30
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