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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » shannon指数的问题
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呆呆小宙斯

铜虫 (初入文坛)

[求助] shannon指数的问题 已有2人参与

关于shannon指数的一些问题求教一下大家：
在高通量测序的时候，不同论文的shannon指数可不可以进行比较呢？比如两个环境的shannon指数，可不可以说shannon指数大的那个环境微生物多样性更为丰富?

@biostar2009 @youlinglyw @wizardfan @飞约疯人院 发自小木虫Android客户端
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1楼 2017-03-23 12:27:46
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敖潇

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
个人觉得可以进行对比，因为他们是用同一个公式计算得出的微生物多样性。不同的采样点，可以进行比较，不同的论文也就相当于不同的采样点，同样可以进行比较。
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2楼2017-03-23 14:35:16
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小马科研部落

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

看一下用哪种方法来算的吧。我试过，用Mothur和R语言计算的shannon和simpson指数，不一样。
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更多内容，请关注微信公众号【小马科研部落】，有问题可找QQ308091253
3楼2017-09-14 16:26:30
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