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各位大神，我最近在用amber做伞形采样计算自由能，大致就是把一个在活性中心的小分子给拉出来脱离蛋白，查看对应的能垒值，得出来的结果不近人意，其实最主要的是我要怎么判断我的结果是不是收敛了，不够收敛的话怎么去改善，是缩短采样间隔？加大每个窗口的采样时间？ 还是说减小拉力？？？求助求助 |
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2楼2017-08-21 08:21:27