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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【讨论】单机多cpu使用vasp
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veryman

木虫 (正式写手)

$_$

[交流] 【讨论】单机多cpu使用vasp

实验室刚买了台工作站，Xerox5405 4核 x2，4G，系统ubuntu server 8.10，ifort11.0，impi3.1，gotoblas，

我编译的并行版本的vasp后直接输入命令vasp开始计算，速度挺快，就是显示8个核心同时到达100%，大家有没有遇到过类似的情况？是不是因为队列管理的问题？
并行版本可以编译无法运行，我用的是mpiifort，貌似装的有点问题，编译的时候会有一个提示，说是[: 455: ==: unexpected operator，这个是什么意思啊？
还有没有什么其它的单节点内并行方法？
我想要安装一个PBS作业管理软件，ubuntu自带的torque serve服务无法开启，大家没有用过什么比较好用的PBS作业管理软件？
还有没有什么我没有注意到的东西？

[ Last edited by wuli8 on 2009-6-13 at 22:47 ]
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1楼 2008-12-28 15:38:02
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y1ding

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
wuli8(金币+2,VIP+0):(*^__^*)
ifort11.0
不要用最新版的ifort去编译vasp
建议用ifort9.1去编译。
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2楼2008-12-28 15:46:07
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hakuna

木虫 (知名作家)
引用回帖:
Originally posted by veryman at 2008-12-28 15:38:
实验室刚买了台工作站，Xerox5405 4核 x2，4G，系统ubuntu server 8.10，ifort11.0，impi3.1，gotoblas，

我编译的并行版本的vasp后直接输入命令vasp开始计算，速度挺快，就是显示8个核心同时到达100%，大家有 ...

没明白你到底编译好了没有.......

管理软件还要消耗系统资源，不装也罢
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3楼2008-12-28 17:38:04
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ytu_cyc

木虫 (著名写手)
不太清楚,帮你顶起来~~~
顶个高手进来~~~~
Good Luck...
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路漫漫其修远兮,吾将上下而求索.
4楼2008-12-28 18:11:37
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wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)
★
jghe(金币+1,VIP+0):感谢你参与讨论！
另外，交换机，网线都要买好的，你的配置相当不错了，所以这方面也一定要好，否则，机器就浪费了  
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5楼2008-12-28 21:19:01
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cos60

木虫 (著名写手)
楼主能否把详细的计算机配置，型号，价格报一下。
偶想说服实验室能否买一台,,,
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6楼2008-12-28 23:22:11
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superest

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
fegg7502(金币+3,VIP+0):thanks,haha
用ifort9.1, mkl9.1, intel mpi 3.1 ,makefile中，都是默认安装，BLAS=  -L/opt/intel/mkl/9.1.023/lib/em64t -lmkl_em64t -lguide -lpthread
应该没问题。我就是这样装的
PS，gotoblas好像没mkl快
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7楼2008-12-29 10:39:42
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veryman

木虫 (正式写手)

$_$
★ ★ ★
wuchenwf(金币+3,VIP+0):谢谢，新年快乐
编译上没什么太大的问题，关键是一运行就8个CPU一起到达100%。
我们买的的HP workstation ws8600，加一台17寸的液晶2W买的。
Xerox5405 4核 x2、4G内存、500G硬盘、NVIDIA Q270的显卡貌似吧。
不过现在学校貌似不给咱boss批，搞不好要退货，说是买台电脑2W太贵……体制啊……凭什么让那么多什么都不懂的人来管理这些需要有专业水平的人才能做的事，又不好好管，影响我们的正常工作……（纯抱怨）
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8楼2008-12-29 18:11:14
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veryman

木虫 (正式写手)

$_$
★
wuchenwf(金币+1,VIP+0):欢迎参加讨论，这些都是几台机器组集群的时候用的，单机不用 :-)
引用回帖:
Originally posted by wuchenwf at 2008-12-28 21:19:
另外，交换机，网线都要买好的，你的配置相当不错了，所以这方面也一定要好，否则，机器就浪费了  

问一下，咱们就一台机器需要这些东西吗？
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9楼2008-12-29 18:13:00
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sunray55

银虫 (小有名气)
★
jghe(金币+1,VIP+0):感谢你参与讨论！
引用回帖:
Originally posted by veryman at 2008-12-29 18:11:
编译上没什么太大的问题，关键是一运行就8个CPU一起到达100%。
我们买的的HP workstation ws8600，加一台17寸的液晶2W买的。
Xerox5405 4核 x2、4G内存、500G硬盘、NVIDIA Q270的显卡貌似吧。
不过现在学校貌似 ...

内存小了点，配置不太合理。个人认为起码要8G。
我们实验室配置基本保证一个CPU配2G内存。
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10楼2008-12-29 19:52:01
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