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billvasp

新虫 (小有名气)

[求助] 单个原子结合能求解,到底指的哪一个??? 已有1人参与

小弟要计算过渡金属原子吸附在二维材料表面的问题,根据要求需要计算结合能,binding energy.

Eb = E(TM) + E(graphene) − E(graphene + TM), where E(TM), E(graphene) and E(graphene + TM) are the energies of the isolated TM atom,
the pristine graphene and the TM atom adsorbed graphene, respectively,TM为过渡金属。

现在单个过渡金属原子的能量,假设其为Co原子,小弟算出来3种:

1. 不开自旋, ISPIN=1,  
POSCAR为
1.0   
8  0  0
0  8  0
0   0  8
1   
direct
0  0  0   
               
KPOINTS为                                          
0                                       
Monkhost pack                                         
1 1 1                                      
0 0 0
POTCAR用的PBE-PAW
INCAR中ISMEAR=0,,,,,,,,,这样优化完结果为: free TOTEN= -0.45900580   energy  without  entropy=-0.37450127 energy(sigma->0)=-0.41675353

2. 开自旋,ISPIN=2, POSCAR晶格常数为 8 0 0, 9 0 0 ,10  0  0,其他设置与1中情况一样,优化完结果为 free TOTEN=-1.75919912,  energy  without  entropy=-1.72248815 energy(sigma->0)=-1.74084364,

3.开自旋,这次我用的是VASP官网的O原子的例子,INCAR中只写了:SYSTEM=Co,ISMEAR=0,ISPIN=2,POSCAR晶格常数为 8 0 0, 9 0 0 ,10 0 0算出来结果free TOTEN=-1.84363826energy  without  entropy=-energy-1.67698926(sigma->0)=-1.76031376,

这3种情况应该以哪一种为准,希望广大虫友给予解答,由于ISMEAR=0,所以我总能取得energy  without  entropy=-0.37450127,不知对不对?????? 还是应该取free  TOTEN的值,这3个能量到底什么区别,再一个,这些能量为什么都是负值??还有就是 E(graphene)和 E(graphene + TM)我取得是结构优化完后OUTCAR中的energy  without  entropy值,不知对不对???还是应该取静态自洽完后的能量值???另外形成能和结合能一样吗???问题有点多?大家帮个忙。
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770968942DX

新虫 (初入文坛)

请问这个问题解决了吗?我最近也遇到了这个问题
2楼2017-05-25 16:44:01
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前田庆次

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

这3种情况应该以哪一种为准,希望广大虫友给予解答,由于ISMEAR=0,所以我总能取得energy  without  entropy=-0.37450127,不知对不对?????? 还是应该取free  TOTEN的值,这3个能量到底什么区别,再一个,这些能量为什么都是负值??
能量负值没问题,自旋肯定要开

还有就是 E(graphene)和 E(graphene + TM)我取得是结构优化完后OUTCAR中的energy  without  entropy值,不知对不对???还是应该取静态自洽完后的能量值???另外形成能和结合能一样吗???问题有点多?大家帮个忙。
取OSZICAR里的能量即可
结合能与形成能不一样,多看文献
长枪一横花飘零,松风追月伴我行。无双人间世如梦,倾奇万世永留名。
3楼2018-01-30 18:02:22
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