24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2351  |  回复: 2
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

hee_csu

新虫 (著名写手)

[求助] ORCA计算MP2结构优化,报错:内存不够

请教大神,ORCA计算MP2结构优化,报错:内存不够,如何处理?

输入文件:
! RI-MP2 SV(P) SV/J OPT RIJK
!pal8
%basis NewGTO 51 "TZVPP" end
       NewAuxGTo 51 "TZV/J" end
       end  
* xyz 0 1
N                 -5.92810700    1.97759000   -0.44312200
H                 -6.93248600    2.13900700   -0.52054900
H                 -5.74746200    1.09670600   -0.92734700
C                 -5.19445200    3.06602600   -1.08983800
H                 -5.10942300    3.89482700   -0.37339800
C                 -3.78064200    2.60102300   -1.49249500
C                 -5.96436100    3.59390500   -2.29328800
H                 -3.47920900    1.80715000   -0.79683400
H                 -3.79290500    2.16101000   -2.49685000
C                 -2.75058400    3.73252300   -1.45035700
O                 -7.00717500    3.13575600   -2.69217500
H                 -3.15856700    4.61886400   -1.94819900
H                 -2.55380900    3.99799400   -0.40808500
C                 -1.49548300    3.36938600   -2.24135400
O                 -1.59780000    3.03352100   -3.40958900
O                 -5.35219400    4.64053300   -2.86521100
H                 -5.87362700    4.90968000   -3.64296800
N                 -0.28235000    3.45332300   -1.62063500
H                  0.53767700    3.32960900   -2.21448700
C                 -0.03743600    3.90059400   -0.27082600
H                 -0.67996200    4.76046000   -0.03816900
C                 -0.31606300    2.80027200    0.77879600
C                  1.40906700    4.40238300   -0.19098100
H                 -0.55631300    3.25244300    1.74851500
H                 -1.19385400    2.22744300    0.46023700
S                  1.06426800    1.65811500    1.14794900
O                  2.17183700    4.33692300   -1.13804800
N                  1.77237800    4.91887400    1.01015300
H                  1.17326600    4.80429400    1.82125200
C                  3.17578600    5.08830600    1.30209900
C                  3.35249700    5.14824700    2.79906500
H                  3.75721700    4.24766100    0.90158300
H                  3.58074300    6.00228100    0.85352100
O                  2.45521400    5.04622000    3.60128700
O                  4.63375500    5.33011100    3.13904900
H                  4.68640500    5.34712500    4.11140100
S                  2.68543200    1.33121500   -2.06110900
C                  3.47166100    0.03088100   -3.11250000
C                  3.72239700   -1.31907500   -2.40824500
H                  4.43219300    0.46206300   -3.40549300
H                  2.85790300   -0.11283000   -4.00305100
N                  5.08767100   -1.79478200   -2.38855000
H                  3.45830700   -1.20779300   -1.35680000
C                  2.69732700   -2.36018500   -2.84304100
C                  5.92166000   -1.69277200   -1.28345300
H                  5.58665800   -1.89321800   -3.26800400
O                  1.55409700   -2.01393400   -3.12357700
N                  3.07420200   -3.65778700   -2.78118900
C                  5.24597600   -1.32397400    0.02878400
O                  7.11197700   -1.91583200   -1.38574200
H                  3.98477000   -3.86399200   -2.39074900
C                  2.04413400   -4.66524700   -2.81464800
C                  6.18034200   -1.35207100    1.22923100
H                  4.39930000   -2.00342600    0.19670100
H                  4.81016700   -0.31901300   -0.07610800
C                  0.99759600   -4.42810700   -1.72946800
H                  1.53327700   -4.66333100   -3.78104900
H                  2.49174000   -5.65160600   -2.66885400
C                  5.51581500   -0.75137300    2.47826600
H                  7.09204800   -0.78515700    1.02436600
H                  6.48559700   -2.38311400    1.44560800
O                  1.18707000   -3.73605000   -0.74874900
O                 -0.12609000   -5.06273900   -1.99977500
N                  6.43980200   -0.84997000    3.59703600
H                  5.30276100    0.30695500    2.28922500
C                  4.18461100   -1.45823100    2.75167700
H                 -0.81967400   -4.83246600   -1.32259600
H                  6.05589300   -0.37686800    4.41228500
H                  6.53314100   -1.83108300    3.85876500
O                  4.09885300   -2.48184700    3.38982100
O                  3.13541500   -0.83605100    2.19699200
H                  2.29518000   -1.30963600    2.41636100
S                 -0.97962200    0.19391300   -1.59035000
C                 -1.48566300   -1.56620900   -1.48624700
C                 -1.90071700   -1.97506000   -0.06476000
N                 -0.75420700   -2.10855700    0.81134800
H                 -2.56270600   -1.20387200    0.32676800
C                 -2.67343000   -3.29421500   -0.09569300
C                 -0.51542900   -1.44247200    1.97475300
H                 -0.04471400   -2.79311300    0.53429100
O                 -2.14760700   -4.36448600   -0.41534900
N                 -3.97002900   -3.20109100    0.24463200
C                 -1.55795000   -0.45531800    2.46373800
O                  0.52353700   -1.64221100    2.60157500
H                 -4.33274900   -2.30274500    0.57601600
C                 -4.81053500   -4.36733400    0.32882500
C                 -2.76238400   -1.15282600    3.11627800
H                 -1.87741500    0.18013400    1.62624300
H                 -1.05139200    0.18949400    3.18580400
C                 -5.68617400   -4.29201300    1.55797900
H                 -5.45847300   -4.47708800   -0.54995400
H                 -4.18163300   -5.26137200    0.37952600
C                 -3.93772800   -0.20203000    3.31316500
H                 -2.47656000   -1.54646400    4.09594700
H                 -3.10116500   -2.00780600    2.51769000
O                 -5.70966300   -3.37131000    2.33906600
O                 -6.46010400   -5.37691600    1.67011600
N                 -4.98504600   -0.85890400    4.08942100
H                 -3.61191900    0.68501200    3.86786500
C                 -4.49244500    0.26945400    1.96887000
H                 -7.00428200   -5.27981600    2.47245200
H                 -5.75156000   -0.21936500    4.28383500
H                 -5.35537000   -1.66090200    3.58082300
O                 -4.54221800   -0.44383300    0.96853300
O                 -4.98021100    1.48995100    1.98980300
H                 -5.39677200    1.69926100    1.06763900
H                 -0.68979900   -2.21206000   -1.87113900
H                 -2.34403900   -1.65933400   -2.16004200
Sb                 1.24800500   -0.03753200   -0.62160200
*

输出文件后部分:
------------------------------------------------------------------------------
                              ORCA MP2 CALCULATION
------------------------------------------------------------------------------

Freezing NCore=190 chemical core electrons

----------------------
RI-MP2 ENERGY+GRADIENT
----------------------
Dimension of the basis                    ... 1016
Memory devoted to MP2                     ...  256 MB   
Data format for buffers                   ... DOUBLE
Compression type for matrix containers    ... UNCOMPRESSED
Overall scaling of the MP2 energy         ...   1.000e+00 Eh
Calculating two index integrals           ... done (    0.151 sec)
Cholesky decomposition of the V-matrix    ... done
Cholesky decomposition of V**-1           ... done (    1.120 sec)

-----------------
RI-TRANSFORMATION (AUX index driven)
-----------------

Dimension of the orbital-basis         ... 1016
Dimension of the aux-basis             ... 2563
Transformation of internal MOs         ...    0- 266
Transformation of internal/external MOs...    0- 266 to  267-1015
Number Format for Storage              ... Double (8 Byte)
Integral mode                          ... Direct
Process 0: Error (ORCA/RI-TRAFO): Not enough memory in RI-Trafo (need 90.57199096680 MB)
Process 6: Error (ORCA/RI-TRAFO): Not enough memory in RI-Trafo (need 90.57199096680 MB)
Process 7: Error (ORCA/RI-TRAFO): Not enough memory in RI-Trafo (need 90.57199096680 MB)
Process 1: Error (ORCA/RI-TRAFO): Not enough memory in RI-Trafo (need 90.57199096680 MB)
Process 2: Error (ORCA/RI-TRAFO): Not enough memory in RI-Trafo (need 90.57199096680 MB)
Process 3: Error (ORCA/RI-TRAFO): Not enough memory in RI-Trafo (need 90.57199096680 MB)
Process 4: Error (ORCA/RI-TRAFO): Not enough memory in RI-Trafo (need 90.57199096680 MB)
Process 5: Error (ORCA/RI-TRAFO): Not enough memory in RI-Trafo (need 90.57199096680 MB)

An error has occured in the MP2 module
CALLING COMMAND: mpirun -np 8  /home/yonghui/chemsoft/orca_3_0_1_linux_x86-64/orca_mp2_mpi Sb-GS3-MP2.mp2inp.tmp
RETURN CODE    : 3072
ABORTING THE RUN

请大神指点,非常感谢!
回复此楼
今天有点凉
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独孤立啊

铜虫 (正式写手)

请问这个基组水平中RI是什么意思呢?怎么在Gaussian 03中设置呢?谢谢
3楼2017-11-09 08:02:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答

zhaoyangqufu

至尊木虫 (知名作家)

2楼2017-03-20 15:31:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 通信工程求调剂!!! +7 zlb770521 2026-04-14 7/350 2026-04-19 20:56 by Equinoxhua
[考博] 申博自荐 +4 Linxia林夏 2026-04-13 4/200 2026-04-19 19:55 by Equinoxhua
[考研] 291求调剂 +11 关忆北. 2026-04-14 11/550 2026-04-19 17:16 by 中豫男
[考研] 求调剂推荐 +9 小聂爱学习 2026-04-14 9/450 2026-04-19 17:03 by 中豫男
[考研] 求调剂 +10 小聂爱学习 2026-04-16 12/600 2026-04-19 16:51 by 中豫男
[考研] 291求调剂 +12 关忆北. 2026-04-14 13/650 2026-04-19 16:50 by 中豫男
[考研] 085404 22408 309分求调剂 +10 lzmk 2026-04-14 11/550 2026-04-19 16:42 by 中豫男
[考研] 求调剂 +6 苦命人。。。 2026-04-18 7/350 2026-04-19 16:27 by 中豫男
[考研] 300求调剂 +12 橙a777 2026-04-15 12/600 2026-04-18 23:51 by 路病情
[考研] 297,工科调剂? +5 河南农业大学-能 2026-04-14 5/250 2026-04-18 15:17 by Equinoxhua
[考博] 申博/考博 +3 啃面包的小书虫 2026-04-17 4/200 2026-04-17 23:54 by 阳阳阳^_^
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
[考研] 297,工科调剂?河南农业大学本科 +14 河南农业大学-能 2026-04-14 14/700 2026-04-16 14:41 by dingyanbo1
[考研] 085801电气专硕272求调剂 +19 电气李 2026-04-13 21/1050 2026-04-15 13:37 by 黑科技矿业
[教师之家] 转长聘了 +7 简单化xn 2026-04-13 7/350 2026-04-14 14:50 by xindong
[考研] 求调剂 +12 何气正 2026-04-13 13/650 2026-04-14 14:47 by zs92450
[考研] 085408光电信息工程专硕355一志愿长春光机所调剂 +6 王ymaa 2026-04-13 13/650 2026-04-14 11:33 by 王ymaa
[考研] 085600材料与化工329分求调剂 +24 叶zilin 2026-04-13 25/1250 2026-04-14 09:20 by 试管破裂
[考研] 302求调剂 +10 易!? 2026-04-13 10/500 2026-04-13 19:04 by lbsjt
信息提示
请填处理意见