| 查看: 1175 | 回复: 0 | |||
mine2mine金虫 (小有名气)
|
[交流]
求助！！关于蛋白序列和转录组数据比对
|
| 之前在实验室分到了一个蛋白，做了肽指纹图谱PMF，拿到了三个氨基酸序列，但是都不大，不到20 kD。我想拿到这个蛋白的全序列或者CDS序列。因为NCBI上有该物种的转录组数据库，因此我想用蛋白序列与NCBI里的SRA转录组数据进行tblastn比对。但是没有比对出结果。我想知道我的这个思路是否可行？没有结果是由哪些原因导致的？是氨基酸序列不够长还是MAlDI-MSMS做的这个PMF序列不太可信呢？还是其他原因？鉴于我的这种情况，有没有更好的方法来达到我的目的，拿到这个蛋白的氨基酸/基因序列？ |
回复此楼» 猜你喜欢
筑牢营养安全线：以精准检测，护健康基石
已经有0人回复
-
推荐一些20种氨基酸检测的实际应用案例
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有262人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
