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goodllian

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[求助] 求助超算计算过渡态已有1人参与

我想在超算上用MS的CASTEP模块计算过渡态，反应物的模型和生成物模型都已生成，并且配对完毕，但是不知道需要在超算上上传什么文件，我上传的*.cell和*.param,以及超算的导入文件runjob.lsf文件。但这个runjob.lsf文件的内容是之前计算几何优化和电子结构的，我也不知道合适不，就先用上，结果提交计算后立即就失败了，请教高手是什么问题，是提交文件不对的问题还是runjob.lsf文件的内容错误的问题。非常感谢，我会送您金币和红花的，望不吝赐教！

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1楼 2017-03-15 11:33:06

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zhangfrank

金虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
goodllian(蛋蛋小童鞋代发): 金币+2, 谢谢参与，小木虫鼓励积极回答问题者 2017-03-15 14:45:03

并没有用过castep和算过渡态，但是根据经验，原因之一可能是你的runjob.lsf有问题

通常的runjob.lsf是指定了core node计算。但是你在算neb的时候，是需要根据你image的个数选image个数的整数倍来设定node。所以你修改下node个数再试试呢？

当然，我也不确定这个建议是否有用。

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goodllian

计算顺利点吧

2楼2017-03-15 12:25:28

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goodllian

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引用回帖:

2楼: Originally posted by zhangfrank at 2017-03-15 12:25:28
并没有用过castep和算过渡态，但是根据经验，原因之一可能是你的runjob.lsf有问题

通常的runjob.lsf是指定了core node计算。但是你在算neb的时候，是需要根据你image的个数选image个数的整数倍来设定node。所以你 ...

image是指反应物和生成物这种模型的个数？core node是指CPU的核心数吧

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3楼2017-03-15 15:04:59

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