24小时热门版块排行榜    

查看: 1902  |  回复: 14

yyao_1314

木虫 (小有名气)

[求助] 求助Freq计算到一半就突然断掉 已有1人参与

大致推测是内存的问题,文件没有任何提示错误的信息,以258 vectors of produced by pass 6结束......

求助怎么设置比较好。
工作站:64GB/32核

com文件设置:
%mem=60GB
%nprocshared=8
方法:M062X,基组6-31G**,基函数2054个。

发自小木虫IOS客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

总是无情却有情
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

你用的是windows操作系统吧?该系统最大只能给出16GB的外存,所以外存写不下就停止了。作freq需要很大的外存空间。
2楼2017-03-06 11:22:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyao_1314

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2017-03-06 11:22:26
你用的是windows操作系统吧?该系统最大只能给出16GB的外存,所以外存写不下就停止了。

linux 64位

发自小木虫IOS客户端
总是无情却有情
3楼2017-03-06 11:22:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by yyao_1314 at 2017-03-06 11:22:48
linux 64位
...

那应不是外存的问题。
sobereva在《量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法》的帖子中说:

使用更好的Hessian矩阵
RFO、GDIIS、GEDIIS这三种优化方法在走步时都需要Hessian矩阵(力常数矩阵),然而计算Hessian矩阵是很耗时的。因此,在默认情况下,Gaussian会通过价力场的方法近似估计出初始的Hessian矩阵,在每一步优化中只精确计算梯度,利用梯度对原先Hessian矩阵进行修正不断得到新的Hessian矩阵。所以,在默认情况下,优化从头到尾使用的Hessian矩阵都只是近似的(这也是为什么在优化出来的结构上做Freq往往会显示还没收敛,因为Freq用的是精确的Hessian矩阵)。当Hessian矩阵离精确值偏差较大,就会造成收敛缓慢,或者始终不收敛。为解决这个问题,可以用opt=calcfc,这会在优化的第一步使用精确计算的Hessian矩阵,但是仍可能后续优化过程中Hessian矩阵逐渐变得越来越不精确而依然收敛失败。opt=calcall则不仅在第一步,在后续的每一步中也都精确计算Hessian矩阵,这使得很多优化失败的情况都能得到解决,优化所需步数通常也会减少很多,而且能够保证最终优化结果准确(因为最终判断是否收敛时是基于精确的Hessian矩阵所得结果),但代价是每一步计算量会很大。

可供参考。
4楼2017-03-06 14:24:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyao_1314

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zhou2009 at 2017-03-06 14:24:23
那应不是外存的问题。
sobereva在《量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法》的帖子中说:

使用更好的Hessian矩阵
RFO、GDIIS、GEDIIS这三种优化方法在走步时都需要Hessian矩阵(力常数矩阵),然而计 ...

谢谢提供信息,结构已经优化好,单独freq计算过程中出的问题,跟结构优化没有关系。

发自小木虫IOS客户端
总是无情却有情
5楼2017-03-06 15:39:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小范范1989

木虫 (著名写手)

按说不是内存问题,你的内存应该够了。
断电过?或者时间到了?
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
6楼2017-03-06 19:36:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

注意这段:
在默认情况下,优化从头到尾使用的Hessian矩阵都只是近似的(这也是为什么在优化出来的结构上做Freq往往会显示还没收敛,因为Freq用的是精确的Hessian矩阵)。当Hessian矩阵离精确值偏差较大,就会造成收敛缓慢,或者始终不收敛。
7楼2017-03-06 20:27:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyao_1314

木虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 小范范1989 at 2017-03-06 19:36:46
按说不是内存问题,你的内存应该够了。
断电过?或者时间到了?

不是,测试过很多次,体系大了才会出这个问题。1400个基函数的体系感觉刚好能计算。应该是高斯计算需要一个内存,此外还需要额外的缓存。如果不够,系统就会强制停止计算。暂时只能用4核来慢慢算,再看看结果。

发自小木虫IOS客户端
总是无情却有情
8楼2017-03-06 21:57:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yyao_1314

木虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by zhou2009 at 2017-03-06 20:27:16
注意这段:
在默认情况下,优化从头到尾使用的Hessian矩阵都只是近似的(这也是为什么在优化出来的结构上做Freq往往会显示还没收敛,因为Freq用的是精确的Hessian矩阵)。当Hessian矩阵离精确值偏差较大,就会造成 ...

较小的体系可以,大了就算不过去,应该跟你说的没有关系。试过其他情况下,也算不过气。

发自小木虫IOS客户端
总是无情却有情
9楼2017-03-06 21:59:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paramecium86

版主 (著名写手)

Gaussian算freq会有两种方法 第一种直接使用内存计算CPHF, 但是如果超过5000个CPHF function那就自动转入省内存模式  要把计算中间结果往硬盘里写。 我的感觉是这个情况: 因为要写入硬盘的数据量太大了 硬盘写入速度又不快 会非常慢 所以怎么都算不下去。用maxinv 试试加到10000  只要内存够大应该能算得下去。
10楼2017-03-07 08:14:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yyao_1314 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 340求调剂 +5 话梅糖111 2026-03-24 5/250 2026-03-25 06:53 by ilovexiaobin
[考研] 281求调剂 +3 Koxui 2026-03-24 4/200 2026-03-24 22:59 by barlinike
[考研] 07化学280分求调剂 +6 722865 2026-03-23 6/300 2026-03-24 20:58 by allen-yin
[考研] 一志愿北京化工大学材料与化工 264分各科过A区国家线 +3 哈哈157349 2026-03-21 3/150 2026-03-24 14:11 by zhyzzh
[考研] 求调剂 +7 十三加油 2026-03-21 7/350 2026-03-23 23:48 by 热情沙漠
[考研] 环境学硕288求调剂 +8 皮皮皮123456 2026-03-22 8/400 2026-03-23 23:47 by 热情沙漠
[考研] 一志愿陕师大生物学071000,298分,求调剂 +3 SYA! 2026-03-23 3/150 2026-03-23 19:09 by macy2011
[考研] 0854电子信息求调剂 324 +3 Promise-jyl 2026-03-23 3/150 2026-03-23 13:43 by wangkm
[考研] 319求调剂 +4 小力气珂珂 2026-03-20 4/200 2026-03-22 15:53 by ColorlessPI
[考研] 354求调剂 +7 Tyoumou 2026-03-18 10/500 2026-03-22 11:11 by 人来盛
[考博] 招收博士1-2人 +3 QGZDSYS 2026-03-18 4/200 2026-03-22 10:25 by QGZDSYS
[考研] 297求调剂 +3 喜欢还是不甘心 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:33 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-20 7/350 2026-03-21 16:36 by barlinike
[考研] 求调剂 +6 Mqqqqqq 2026-03-19 6/300 2026-03-21 08:04 by JourneyLucky
[考研] 296求调剂 +6 www_q 2026-03-18 10/500 2026-03-20 23:56 by JourneyLucky
[考研] 274求调剂 +10 S.H1 2026-03-18 10/500 2026-03-20 23:51 by JourneyLucky
[考研] 求调剂一志愿南京航空航天大学289分 +3 @taotao 2026-03-19 3/150 2026-03-20 21:34 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂 +5 西南交通专材355 2026-03-19 5/250 2026-03-20 21:10 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南理工085701环境302求调剂院校 +3 葵梓卫队 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:28 by zhukairuo
[考研] 材料考研调剂 +3 xwt。 2026-03-19 3/150 2026-03-19 11:22 by w沐阳w
信息提示
请填处理意见