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xq0627新虫 (小有名气)
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求助如何下载样本比配的miRNA和lncRNA的表达谱数据 已有1人参与
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| 请问哪位大神知道如何获取到样本比配的miRNA和lncRNA的表达谱数据，目前只知道TCGA可下mRNA/miRNA样本比配数据，紧急求助，谢谢 |
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
xq0627: 金币+1 2017-03-06 15:04:16
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xq0627: 金币+1 2017-03-06 15:04:16
| 是这样，TCGA是肿瘤方向的高通量数据库，包括各类数据，例如表达谱、SNP、甲基化、CNV等，一般初学者我们建议在线查看一下，自己下载分析会比较困难（因为它的数据有芯片有测序，有时这些数据初始解析标准也不一样，往往下载的数据没有可比性）。建议你可以去GEO数据库，GEO数据库除了肿瘤数据外，还涉及其他很多研究方向。可以在GEO数据库（最大的高通量数据库共享平台）中查找自己相关的表达谱数据，比如Affymetrix芯片数据，下载后Affymetrix有官方的软件可以解析分析，非常方便，非常适合初学者。 |
2楼2017-03-06 11:05:04