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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 在gpu上编译并行lammps生成lmp_mpi运行实例出现error
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shuting1994

新虫 (小有名气)

[求助] 在gpu上编译并行lammps生成lmp_mpi运行实例出现error 已有1人参与

组里新买了gpu服务器，硬件装好之后我就开始编译gpu加速的并行lammps，在工程师已经安装好cuda的基础上，lammps的安装顺序是这样的：安装openmpi；安装fftw；安装不添加任何包的并行lammps，生成lmp-mpi；安装lib包；修改gpu包中的Makefile.mpi，安装gpu包成功生成libgpu.a；修改MAKE文件中的Makefile.mpi；之后make yes-xxx各种包；最后make mpi，生成新的lmp_mpi，一切顺利。

但是！！！开始使用lammps自带的gpu加速文件出现错误，是这样的“ERROR: GPU library not compiled for this accelerator (../gpu_extra.h:40)    Cuda driver error 4 in call at file 'geryon/nvd_device.h' in line 124.”已经对gpu包中的Makefile.mpi中的计算能力修改过了，还是没有用。

请问有安装过gpu加速lammps的朋友吗？虚心请教，多谢了！
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1楼 2017-03-03 23:04:58
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

shuting1994

新虫 (小有名气)
问题已经解决了。现在分享gpu lammps安装的方法，最好下最新的稳定的版本的lammps。在16Nov17版本之后，lammps进行安装时，非常便捷，无需再对../MAKE/Makefile.mpi等文件进行编译，官方更新了新的文件，可以自动找到你安装的fft和mpi。之后安装gpu时，注意你的修改文件，首先确定你安装的是单精度还是双精度，两种精度对应更改的文件不一样，找到你所需修改的文件之后，更改gpu的计算能力。返回../src，进行make mpi。可以完成gpu lammps的安装
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4楼2017-03-06 18:00:42
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普通回帖

毅力者强

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
shuting1994: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2017-03-06 17:56:44
ERROR: GPU library not compiled for this accelerator ，GPU cuda安装的是哪个版本的？或许是因为没有加入环境变量的缘故。
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2楼2017-03-06 14:03:35
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shuting1994

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 毅力者强 at 2017-03-06 14:03:35
ERROR: GPU library not compiled for this accelerator ，GPU cuda安装的是哪个版本的？或许是因为没有加入环境变量的缘故。

lammps安装的是16Nov17版本的，cuda安装的8.0。哈哈，感谢，问题已经解决啦。
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3楼2017-03-06 17:56:39
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starlink

木虫 (正式写手)
楼主用的什么gpu显卡
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5楼2017-04-13 15:53:54
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starlink

木虫 (正式写手)
楼主能不能给一个显卡型号，以及与cpu的效率对比，方便后人了解，谢谢。感觉现在gpu加速是个大趋势，但是做这方面评测的太少，有钱人买tesla，没钱的可能就只能考虑消费级geforce，无奈geforce型号众多，简直无从下手。
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6楼2017-04-14 12:42:00
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你来说说看

新虫 (初入文坛)
楼主，请问一下，你的系统是什么，我这边CentOS的系统，CUDA安装比较难跟着教程走。有什么可以指导的吗
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7楼2017-04-25 09:18:33
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mengfan

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by shuting1994 at 2017-03-06 18:00:42
问题已经解决了。现在分享gpu lammps安装的方法，最好下最新的稳定的版本的lammps。在16Nov17版本之后，lammps进行安装时，非常便捷，无需再对../MAKE/Makefile.mpi等文件进行编译，官方更新了新的文件，可以自动找 ...

请问楼主，单精度/双精度需要修改什么文件呢。我只修改了gpu计算能力，但是运行时遇到了跟你类似的错误。还望指教。
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

tina张
XeTaL
8楼2017-05-23 11:38:12
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deepbluezq

新虫 (初入文坛)
你好，我在安装lammps的gpu package时，出现错误。
[zhangq@gpu01 src]$ make yes-asphere
Installing package asphere
  updating package GPU
[zhangq@gpu01 src]$ make yes-kspace
Installing package kspace
  updating package GPU
[zhangq@gpu01 src]$ make yes-gpu
Installing package gpu
[zhangq@gpu01 src]$ make linux
make: *** [linux] Error 1
zhangq@gpu01 gpu]$ mpirun -np 8 lammps<in.melt
LAMMPS (30 Jul 2016)
ERROR: Package gpu command without GPU package installed (../input.cpp:1571)

能帮我分析解决一下吗？感激
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9楼2017-09-10 12:54:26
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菜鸟他哥

银虫 (初入文坛)
哈哈哈，口令不一样的

发自小木虫IOS客户端
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幸福生活，快乐工作
10楼2017-09-30 04:30:29
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