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zhangfrank

金虫 (正式写手)

[求助] 【求助】关于单层MOS2吸附非金属元素体系的范德瓦尔斯计算 已有2人参与

如题,
1. 关于单层MOS2吸附非金属元素体系(比如O)的体系,一定要加范德瓦尔斯计算么

2. 如果一定要加,manul中很多种类,如下,对我的体系,要选哪个情况呢?  我的版本是vasp.5.4.1.24Jun15
IVDW=0 no correction
IVDW=1     ##  DFT-D2 method of Grimme (available as of VASP.5.2.11)
IVDW=11   ## zero damping DFT-D3 method of Grimme (available as of VASP.5.3.4)
IVDW=12   ## DFT-D3 method with Becke-Jonson damping (available as of VASP.5.3.4)
IVDW=2     ## Tkatchenko-Scheffler method (available as of VASP.5.3.3)
IVDW=21   ## Tkatchenko-Scheffler method with iterative Hirshfeld partitioning (available as of VASP.5.3.5)
IVDW=202 ##Many-body dispersion energy method (MBD@rSC) (available as of VASP.5.4.1)
IVDW=4     ## dDsC dispersion correction method (available as of VASP.5.4.1)

All methods listed above add vdW correction to potential energy, interatomic forces, as well as stress tensor and hence simulations such as atomic and lattice relaxations, molecular dynamics, and vibrational analysis (via finite differences) can be performed. Note, however, that these correction schemes are currently not available for calculations based on density functional perturbation theory.

3. DFT-vdW 跟DFT-D2就是一回事么? 上面列出了的DFT-D2 DFT-D3 DFT-TS 等有什么区别 (看manul已经看晕了)

4. 选定好某种vdw泛函后,POTCAR文件是否可以依旧使用之前用的PBE version POTCAR?

5. vdW-DF,optPBE-vdW,optB88-vdW ,optB86b-vdW,vdW-DF2 , 是一种什么样的泛函?分别用于什么体系的范德瓦斯修正呢?

6. 以DFT-D2为例,manual里面给的这些参数都要进行设置出来么?哪些是必须要有哪些是可以缺省的呢?
VDW_RADIUS        = 50.0
VDW_S6        = 0.75
VDW_SR        = 1.00
VDW_SCALING        =0.75
VDW_D        = 20.0
VDW_C6        = [real array]
VDW_R0        = [real array]
LVDW_EWALD        = .FALSE.$ \vert$.TRUE.

特别的,VDW_RADIUS        = 50.0 这个参数到底要怎么设置呢?我看帖子里有人甚至都有用10 20 30



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前田庆次

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhangfrank(蛋蛋小童鞋代发): 金币+5, 谢谢参与,小木虫鼓励积极回答问题者 2017-03-02 10:39:33
zhangfrank: 金币+10, ★★★很有帮助 2017-03-02 14:44:27
如题,
1. 关于单层MOS2吸附非金属元素体系(比如O)的体系,一定要加范德瓦尔斯计算么

给你篇文献自己看:
Magnetic properties of nonmetal atoms absorbed MoS[sub 2] monolayers

2. 如果一定要加,manul中很多种类,如下,对我的体系,要选哪个情况呢?  我的版本是vasp.5.4.1.24Jun15
IVDW=0 no correction
IVDW=1     ##  DFT-D2 method of Grimme (available as of VASP.5.2.11)
IVDW=11   ## zero damping DFT-D3 method of Grimme (available as of VASP.5.3.4)
IVDW=12   ## DFT-D3 method with Becke-Jonson damping (available as of VASP.5.3.4)
IVDW=2     ## Tkatchenko-Scheffler method (available as of VASP.5.3.3)
IVDW=21   ## Tkatchenko-Scheffler method with iterative Hirshfeld partitioning (available as of VASP.5.3.5)
IVDW=202 ##Many-body dispersion energy method (MBD@rSC) (available as of VASP.5.4.1)
IVDW=4     ## dDsC dispersion correction method (available as of VASP.5.4.1)

All methods listed above add vdW correction to potential energy, interatomic forces, as well as stress tensor and hence simulations such as atomic and lattice relaxations, molecular dynamics, and vibrational analysis (via finite differences) can be performed. Note, however, that these correction schemes are currently not available for calculations based on density functional perturbation theory.

这个要看你自己爱好了,我一般都是D3, opt86 88

3. DFT-vdW 跟DFT-D2就是一回事么? 上面列出了的DFT-D2 DFT-D3 DFT-TS 等有什么区别 (看manul已经看晕了)

TS不太建议,就D3吧

4. 选定好某种vdw泛函后,POTCAR文件是否可以依旧使用之前用的PBE version POTCAR?

Grimme方法,opt86 88都是一样的,其余的我不确定

5. vdW-DF,optPBE-vdW,optB88-vdW ,optB86b-vdW,vdW-DF2 , 是一种什么样的泛函?分别用于什么体系的范德瓦斯修正呢?

还是给你几篇文章吧
DOI:
10.1002/jcc.20495
10.1002/jcc.20570
10.1021/jp106469x
10.1088/0953-8984/23/39/395001
10.1021/ct200625h

6. 以DFT-D2为例,manual里面给的这些参数都要进行设置出来么?哪些是必须要有哪些是可以缺省的呢?
VDW_RADIUS        = 50.0
VDW_S6        = 0.75
VDW_SR        = 1.00
VDW_SCALING        =0.75
VDW_D        = 20.0
VDW_C6        = [real array]
VDW_R0        = [real array]
LVDW_EWALD        = .FALSE.$ \vert$.TRUE.

特别的,VDW_RADIUS        = 50.0 这个参数到底要怎么设置呢?我看帖子里有人甚至都有用10 20 30

默认就行,除非特殊情况

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长枪一横花飘零,松风追月伴我行。无双人间世如梦,倾奇万世永留名。
3楼2017-03-02 09:52:29
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前田庆次

木虫 (著名写手)

引用回帖:
13楼: Originally posted by 13574803316 at 2018-06-05 21:19:01
请问一下,PBE-D3,INCAR里的VDW_S6,S8,SR该如何设定数值?...

默认
长枪一横花飘零,松风追月伴我行。无双人间世如梦,倾奇万世永留名。
14楼2018-06-06 10:01:43
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