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在open suselinux 11 64位系统上安装vasp5.2时，安装openmpi出问题了！ 已有2人参与
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各位大神，本人用了一段时间的vasp，但是最近想在自己的服务器上面安装vasp5.2版本，在安装的过程中遇到了一些问题，我用的操作系统是open suselinux enterprise 11 64位，编译器使用的是parallel_studio_xe_2017_update1，openmpi-1.6.5，在安装openmpi时，遇到了一些问题，解压tar –zxvf openmpi-1.6.5.tgz后，进行配置文件，./configure –prefix=/home/xyz/software/openmpi(文件夹事先已经建好) CC=icc CXX=icpc F77=ifort FC=ifort，按回车，出现以下的问题： == Configuring Open MPI ============================================================================ *** Startup tests checking build system type... x86_64-unknown-linux-gnu checking host system type... x86_64-unknown-linux-gnu checking target system type... x86_64-unknown-linux-gnu checking for gcc... icc checking whether the C compiler works... no configure: error: in `/home/xyz/software/openmpi-1.6.5': configure: error: C compiler cannot create executables See `config.log' for more details 随后，我查看了config.log的文件，发现错误在 configure:5428: icc conftest.c >&5 /opt/intel/compilers_and_libraries_2017.1.132/linux/bin/intel64/mcpcom: /usr/lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3 .4.11' not found (required by /opt/intel/compilers_and_libraries_2017.1.132/linux/bin/intel64/mcpcom) compilation aborted for conftest.c (code 1) 用strings libstdc++.so.6|grep GLIBC*查看里面的GLIBC得到如下的信息： (none):/usr/lib64 # strings libstdc++.so.6|grep GLIBC GLIBCXX_3.4 GLIBCXX_3.4.1 GLIBCXX_3.4.2 GLIBCXX_3.4.3 GLIBCXX_3.4.4 GLIBCXX_3.4.5 GLIBCXX_3.4.6 GLIBCXX_3.4.7 GLIBCXX_3.4.8 GLIBCXX_3.4.9 GLIBCXX_3.4.10 GLIBC_2.2.5 GLIBC_2.3 GLIBCXX_FORCE_NEW GLIBCXX_DEBUG_MESSAGE_LENGTH 这个表明gcc库里面没有编译要到的GLIBCXX—3.4.11，所以我在网上下载到了libstdc++.so.6.0.17,根据人家提供的方法，先是拷贝到/usr/lib64/下面，然后rm libstdc++.so.6，重新建立链接ln –s libstdc++.so.6.17 libstdc++.so.6，接着查看又出现如下的问题 configure:5366: checking for C compiler version configure:5375: icc --version >&5 icc: symbol lookup error: /usr/lib64/libstdc++.so.6: undefined symbol: _ZNSt8messagesIcE2idE, version GLIBCXX_3.4 configure:5386: $? = 127 configure:5375: icc -v >&5 icc: symbol lookup error: /usr/lib64/libstdc++.so.6: undefined symbol: _ZNSt8messagesIcE2idE, version GLIBCXX_3.4 configure:5386: $? = 127 configure:5375: icc -V >&5 icc: symbol lookup error: /usr/lib64/libstdc++.so.6: undefined symbol: _ZNSt8messagesIcE2idE, version GLIBCXX_3.4 configure:5386: $? = 127 configure:5375: icc -qversion >&5 icc: symbol lookup error: /usr/lib64/libstdc++.so.6: undefined symbol: _ZNSt8messagesIcE2idE, version GLIBCXX_3.4 configure:5386: $? = 127 configure:5406: checking whether the C compiler works configure:5428: icc conftest.c >&5 icc: symbol lookup error: /usr/lib64/libstdc++.so.6: undefined symbol: _ZNSt8messagesIcE2idE, version GLIBCXX_3.4 configure:5432: $? = 127 到这一步，我也查了网上给的方法，但是都没有效果，我想问一下各位大神，遇到这种情况应该如何去解决呢？在open suselinux 11 64位系统上，应该选用什么样的mpi、fftw、ifort编译器比较好一点呢？我的联系方式：1403877039@qq.com先谢谢各位了！！  !!!!错误图示见附件！ |
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2017-03-01 00:41:55, 109.3 K
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