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汕头大学海洋科学接受调剂
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feifanmg

新虫 (初入文坛)

[求助] LAMMPS模拟均聚物拉伸,采用dpd、srp、msrp方法得到的应力应变图都是趋近0,求指导 已有1人参与

链长40,分子数3000,dpd方法的in文件
variable simname index nc10_c11000
units           lj
atom_style      full
boundary p p p

special_bonds lj/coul 1 1 1
newton on on

# save an extra atom type for bond particles
read_data data.chain

neighbor        2.0 bin
neigh_modify    every 10 check yes

bond_style      harmonic
bond_coeff      * 225.0 0.85

comm_modify vel yes

# must use pair hybrid, since srp bond particles
# do not interact with other atoms types
pair_style      dpd 1.0 1.0 373692
pair_coeff      1 1 60.0 4.5 1.0
thermo 1000
thermo_style custom step temp pe  press atoms  lx ly lz
dump               1 all custom 10000 dump1.lammpstrj id type x y z
fix  1 all nve
timestep        0.01

run          200000

unfix 1
#####################################################
# Uniaxial Tensile Deformation
run 0
variable tmp equal "lx"
variable L0 equal ${tmp}
variable strain equal "(lx - v_L0)/v_L0"
variable p1 equal "v_strain"
variable p2 equal "-pxx/10000*1.01325"
variable p3 equal "-pyy/10000*1.01325"
variable p4 equal "-pzz/10000*1.01325"
variable p5 equal "lx"
variable p6 equal "ly"
variable p7 equal "lz"
variable p8 equal "temp"
fix                1 all npt temp 1 1 1 y 0 0 1000 z 0 0 1000 drag 2
fix                2 all deform 1 x erate 1e-5 units box remap x
fix def1 all print 1000 "${p1} ${p2} ${p3} ${p4} ${p5} ${p6} ${p7} ${p8}" file ${simname}.def1.txt screen no
dump               2 all custom 10000 dump2.lammpstrj id type x y z
thermo_style        custom step temp pxx pyy pzz lx ly lz
thermo          1000
timestep        0.01
reset_timestep        0
run                500000
unfix 2
unfix def1
------------------------------
srp方法的in文件如下
variable simname index nc10_c11000
units           lj
atom_style      full
boundary p p p

special_bonds lj/coul 1 1 1
newton on on

# save an extra atom type for bond particles
read_data data.chain

neighbor        2.0 bin
neigh_modify    every 10 check yes

bond_style      harmonic
bond_coeff      * 225.0 0.85

comm_modify vel yes

# must use pair hybrid, since srp bond particles
# do not interact with other atoms types
pair_style      hybrid dpd 1.0 1.0 373692 srp 0.8 1 mid
pair_coeff      1 1 dpd 60.0 4.5 1.0
pair_coeff      1 2 none
pair_coeff      2 2 srp 100.0

# auto normalization of thermo quantites is turned off by pair srp
# just divide by natoms
variable        natoms equal count(all)
variable        nPotEng equal c_thermo_pe/v_natoms

thermo 1000
thermo_style custom step temp pe v_nPotEng press atoms v_natoms lx ly lz
dump               1 all custom 10000 dump1.lammpstrj id type x y z
fix  1 all nve
timestep        0.01

run          200000

unfix 1
#####################################################
# Uniaxial Tensile Deformation
run 0
variable tmp equal "lx"
variable L0 equal ${tmp}
variable strain equal "(lx - v_L0)/v_L0"
variable p1 equal "v_strain"
variable p2 equal "-pxx/10000*1.01325"
variable p3 equal "-pyy/10000*1.01325"
variable p4 equal "-pzz/10000*1.01325"
variable p5 equal "lx"
variable p6 equal "ly"
variable p7 equal "lz"
variable p8 equal "temp"
fix                1 all npt temp 1 1 1 y 0 0 1000 z 0 0 1000 drag 2
fix                2 all deform 1 x erate 1e-5 units box remap x
fix def1 all print 1000 "${p1} ${p2} ${p3} ${p4} ${p5} ${p6} ${p7} ${p8}" file ${simname}.def1.txt screen no
dump               2 all custom 10000 dump2.lammpstrj id type x y z
thermo_style        custom step temp pxx pyy pzz v_nPotEng v_natoms lx ly lz
thermo          1000
timestep        0.01
reset_timestep        0
run                500000
unfix 2
unfix def1LAMMPS模拟均聚物拉伸,采用dpd、srp、msrp方法得到的应力应变图都是趋近0,求指导
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LAMMPS模拟均聚物拉伸,采用dpd、srp、msrp方法得到的应力应变图都是趋近0,求指导-1
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LAMMPS模拟均聚物拉伸,采用dpd、srp、msrp方法得到的应力应变图都是趋近0,求指导-2
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LAMMPS模拟均聚物拉伸,采用dpd、srp、msrp方法得到的应力应变图都是趋近0,求指导-3
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cuihuina

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我也做了聚合物的拉伸,拉伸速率还要步长的设置都会对应力产生影响。你可以把速率加上去试试
天道酬勤
2楼2017-04-12 16:56:11
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cuihuina

银虫 (小有名气)

我想问一下,你由上面的三个图怎么处理得到第四个图呢?我做的拉伸应力波动幅度有点大,也想把数据处理的得到类似于图四那样的效果
天道酬勤
3楼2017-04-12 16:58:32
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ILYYLI

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by cuihuina at 2017-04-12 16:58:32
我想问一下,你由上面的三个图怎么处理得到第四个图呢?我做的拉伸应力波动幅度有点大,也想把数据处理的得到类似于图四那样的效果

你好,请问你解决这个问题了吗。我是用弹簧命令拉伸得到拉力,波动也很大。如果有建议,希望交流。谢谢
4楼2019-06-03 23:21:17
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hubinwin6

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cuihuina at 2017-04-12 16:56:11
我也做了聚合物的拉伸,拉伸速率还要步长的设置都会对应力产生影响。你可以把速率加上去试试

请问ms聚合物链怎么转为lammpsdata文件

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5楼2019-06-27 15:11:00
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