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lxj2007

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by 月只蓝 at 2017-03-01 12:07:15
以Discover计算得到的结构导入AC,在AC--calculation--Energy中选个more,把自动计算不勾选,再算。...

老师,不好意思啊,我按您的操作还是不行啊,我是不是还有哪些操作哟点问题,是不是这个版本的MS7.0有问题?
利用MS7.0 来做分子动力学模拟,可compass等力场中没有我研究的气体SO2F2怎么办?
结构倒入.png


利用MS7.0 来做分子动力学模拟,可compass等力场中没有我研究的气体SO2F2怎么办?-1
energy  中的自动计算不勾.png

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11楼2017-03-01 12:50:29
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lxj2007

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by 月只蓝 at 2017-03-01 12:07:15
以Discover计算得到的结构导入AC,在AC--calculation--Energy中选个more,把自动计算不勾选,再算。...

老师好,我的MS版本是V7.0的,是不是版本有差异的缘故?
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12楼2017-03-01 12:54:25
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

引用回帖:
11楼: Originally posted by lxj2007 at 2017-03-01 12:50:29
老师,不好意思啊,我按您的操作还是不行啊,我是不是还有哪些操作哟点问题,是不是这个版本的MS7.0有问题?

结构倒入.png

energy  中的自动计算不勾.png
...

如果Discover计算成功,为何名为3D Atomistic Disco Min的文件中,只有一个结构文件,没有其他计算信息?
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
13楼2017-03-01 13:02:30
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

引用回帖:
12楼: Originally posted by lxj2007 at 2017-03-01 12:54:25
老师好,我的MS版本是V7.0的,是不是版本有差异的缘故?...

不应该是版本问题
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
14楼2017-03-01 13:02:41
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lxj2007

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
13楼: Originally posted by 月只蓝 at 2017-03-01 13:02:30
如果Discover计算成功,为何名为3D Atomistic Disco Min的文件中,只有一个结构文件,没有其他计算信息?...

老师您好!minimer计算成功后有其他信息的(如下图),但在AC-calculation中下拉菜单只能读到结构信息文件,其他文件不显示。如果可以的话老师您的document能不能给我看下(我的邮箱是lxj0824@zjut.edu.cn),我看看是我哪里设置有问题,或者操作还有问题,谢谢老师!
操作流程是:1.建立了3d结构文件,画出了结构;2. 利用discover程序做minimer计算(compass力场),然后生成了下图文件;3.选择AC模块点calculation来构建不定型晶包,按老师给的建议。
利用MS7.0 来做分子动力学模拟,可compass等力场中没有我研究的气体SO2F2怎么办?-2
minimer后生成的文件.png

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15楼2017-03-01 13:38:49
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匿名

用户注销 (小有名气)

本帖仅楼主可见
16楼2017-03-17 23:40:41
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lxj2007

铁虫 (正式写手)

画好分子式后只进行了结构优化,并未构建盒子,问题就出在盒子没法构建成功。(我电脑上结构能优化成功,但盒子没法构建;但是我装在win10的电脑上结构优化minner不成功,盒子能利用AC构建成功,所以很纳闷),不知你能否帮我试下我的分子SO2F2? @月只蓝

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17楼2017-04-12 11:36:26
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lxj2007

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
16楼: Originally posted by minmin-er at 2017-03-17 23:40:41
楼主,你好!我也是做MS动力学的,我想问一下,你之前不是用你画的分子,利用AC构建了一个盒子吗?为什么还要用AC再一次的构建呢?这一步是干什么的呢?我也是新手,有好多不懂得地方,麻烦了!
...

画好分子后,我只进行了结构优化,并未AC构建盒子,我电脑上能进行几何结构优化,但无法AC盒子;win10电脑上能直接构建盒子,但对分子几何优化就出错,不知道什么原因。

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18楼2017-04-12 11:40:14
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swugzlx

金虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by lxj2007 at 2017-03-01 11:30:15
老师好,我补充下还有错误提示(如下图)

error.png
...

COMPASS力场不支持你的这个分子构型,里面是存在不饱和键的,而compass力场就不支持这种类型的分子结构。因此,你必须换一个力场才行!试试吧!
19楼2017-05-04 10:02:23
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swugzlx

金虫 (小有名气)

力场不支持该分子构型!
20楼2017-05-04 10:03:47
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