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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 一个基因被分成了两段序列该怎么解释呢
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hello啊c

新虫 (小有名气)

[交流] 一个基因被分成了两段序列该怎么解释呢

一个基因被分成了两段序列该怎么解释呢
如图所示，我要分析的目的基因在NCBI上有A、B两个片段，一个含有1结构域，另一个含有2和3结构域，而且还是在同一个染色体上的上下游关系，不过相距不算近，中间隔着一些基因，图上的数字就是他们在染色体中的位置。而该家族的其它正常基因都是一个片段完整的拥有3个结构域，排列方式如图的上半部分。怎么就由一个基因变成了两个序列片段了呢？这种现象该如何解释呢？
我基础不太好，请大家多多批评指教，多谢大家！
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1楼 2017-02-25 23:51:59
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莫等闲111

版主 (知名作家)
★ ★
hello啊c(金币+1): 谢谢参与
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-02-26 08:56:20
感觉你表达的有问题，应该是这样的，1是一个CDS区编码一个蛋白，2，3两个ORF编码一个CDS区。一个基因被分开那么就不能表达了，或者说会产生染色体变异。

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3楼2017-02-26 07:47:53
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stevenshi021

新虫 (小有名气)
★
hello啊c(金币+1): 谢谢参与
基因以及蛋白内含子，或者蛋白是复合体由多个蛋白组装

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4楼2017-02-26 08:06:52
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hello啊c

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 莫等闲111 at 2017-02-26 07:47:53
感觉你表达的有问题，应该是这样的，1是一个CDS区编码一个蛋白，2，3两个ORF编码一个CDS区。一个基因被分开那么就不能表达了，或者说会产生染色体变异。

谢谢，这个确实是两个CDS区。我在想是什么原因让本来是一段序列的基因被分成了两个CDS区呢
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5楼2017-02-26 10:24:02
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hello啊c

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by stevenshi021 at 2017-02-26 08:06:52
基因以及蛋白内含子，或者蛋白是复合体由多个蛋白组装

家族其它基因都是一段CDS，编码有三个结构域的蛋白。但是这个基因的预测序列有两段，这样就有两个CDS区，它的序列为什么会被从中间打断呢
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6楼2017-02-26 10:27:20
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stevenshi021

新虫 (小有名气)
那就可能是蛋白质内含子

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7楼2017-02-26 10:28:03
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莫等闲111

版主 (知名作家)
引用回帖:
5楼: Originally posted by hello啊c at 2017-02-26 10:24:02
谢谢，这个确实是两个CDS区。我在想是什么原因让本来是一段序列的基因被分成了两个CDS区呢...

你的2和3应该是2个基因，你看看2和3是否有2个起始密码子和2个终止密码子，也就是说其实2，3各表示一个基因，他们分别表达一段多肽，然后2条肽链在空间上折叠共同生成一个结构域，即2个基因共同表达一个蛋白。而不是你说的基因分2断。2，3共用一套表达系统，几个例子吧，大肠杆菌乳糖操纵子的3个结构基因就是一套表达系统构成的。

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8楼2017-02-26 10:34:30
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hello啊c

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 莫等闲111 at 2017-02-26 10:34:30
你的2和3应该是2个基因，你看看2和3是否有2个起始密码子和2个终止密码子，也就是说其实2，3各表示一个基因，他们分别表达一段多肽，然后2条肽链在空间上折叠共同生成一个结构域，即2个基因共同表达一个蛋白。而不是 ...

谢谢，2和3是两个结构域，只有一个起始密码子和一个终止密码子。NCBI上标注B序列就是一个基因，我们比对发现B序列怎么少了一个结构域1呢（家族内其它基因以及其它物种中的同源基因都是三个结构域）。而后我们又在B序列的上游找到了A序列（A序列并没有被标注为这个基因），结构域预测发现A正好表达少的那个结构域1。他们本该是一个基因，却有两段CDS，至于怎么发挥功能我们现在还研究不了，只想知道是什么原因能让一个基因分开了呢？不知道我解释的清楚不，非常感谢
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10楼2017-02-26 15:53:21
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莫等闲111

版主 (知名作家)
你这是真核生物吧，目测是内含子了。

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11楼2017-02-26 16:02:24
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hello啊c

新虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 莫等闲111 at 2017-02-26 16:02:24
你这是真核生物吧，目测是内含子了。

是的呢，我是做斑马鱼的。谢谢您那么耐心的给我回复
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12楼2017-02-26 19:28:08
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)
★
hello啊c(金币+1): 谢谢参与
有时候内含子可以很长很长很长的。基因也可能有多拷贝，拷贝不完全就这样。
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13楼2017-02-26 20:34:21
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syhorchid2楼
2017-02-26 00:22   回复  
hello啊c(金币+1): 谢谢参与
baichi1212349楼
2017-02-26 10:45   回复  
hello啊c(金币+1): 谢谢参与
嗯 发自小木虫Android客户端
nulipingbo14楼
2018-12-29 15:07   回复  
hello啊c(金币+1): 谢谢参与
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