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wangying0923

金虫 (小有名气)

[求助] 求助!!!微生物全基因组注释问题!!!!!拜托了各位!!! 已有1人参与

本人手上有一微生物全基因组序列,之前公司只是做个精细图,后来我做一代测序形成了全基因序列,但是注释问题这块一直没弄明白,这关系到我六月份的毕业大事,还请各位大神帮帮忙,感激不尽啊!最近用了几个注释软件,先用了RAST,但是RAST结果生成genbank格式,但是跟ncbi上注释差别非常大,然后又用了一个在线网站注释,microbetrakr,这个网站生成的注释结果跟ncbi上下下来的非常像,只是其中的基因名称和蛋白产物都是用hypP来代替,我现在想知道怎么能获得最终像ncbi上的注释的那样,用软件初步的注释结果里面每个基因名称和功能都要自己手动的一个个加进去么,还是有什么软件能直接生成ncbi上有的genbank格式的结果?微生物基因组方面的大神帮帮忙吧,这步没搞通毕业论文写不下去啊!!!!!!拜托!!!!!!!!!!!
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wangying0923

金虫 (小有名气)

为什么都没有人
2楼2017-02-24 20:56:27
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nanhu1984

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wangying0923: 金币+5, 有帮助 2017-07-11 09:08:22
直接提交到NCBI基因组数据库,设定公布日期,选择ncbi给你注释,几天之内就可以得到带注释结果的gbk文件
https://www.microbialgenomic.cn/
3楼2017-02-27 08:53:19
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qiezi_xujie

新虫 (初入文坛)

请问楼主在哪个全基因组测序公司做的?有靠谱的推荐吗
4楼2017-07-10 15:59:28
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wangying0923

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by qiezi_xujie at 2017-07-10 15:59:28
请问楼主在哪个全基因组测序公司做的?有靠谱的推荐吗

这个现在许多公司都能做的~
5楼2017-07-11 09:09:01
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stabilized

银虫 (小有名气)

你去分子那边再问一遍,说不定有收获。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

坚持!
6楼2017-07-11 09:39:56
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wangying0923

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by stabilized at 2017-07-11 09:39:56
你去分子那边再问一遍,说不定有收获。

谢谢~
7楼2017-07-11 12:52:13
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丕龙兄

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by nanhu1984 at 2017-02-27 08:53:19
直接提交到NCBI基因组数据库,设定公布日期,选择ncbi给你注释,几天之内就可以得到带注释结果的gbk文件

ncbi的注释可能会更久

发自小木虫Android客户端
8楼2018-03-30 08:42:54
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秒钟的记忆

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

9楼2018-06-25 23:22:07
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秒钟的记忆

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

10楼2018-06-25 23:23:28
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