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想求助杨树蛋白质组学iTRAQ数据差异倍数的选择
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我在外面公司做的杨树叶片iTRAQ标记蛋白质组学，现在给我的初始数据让我挑选差异倍数。 一共鉴定出7166个蛋白质，公司的人和我说要卡蛋白组通量在5%-15%，也就是说差异蛋白数量要在350-1000大概范围内，这样的话只有1.2和1.3差异倍数符合要求，要我从这两个中间进行选择，可是我看的相关文献都是差异倍数是1.5，但是1.5的差异蛋白量没有那么多，我跟他说文献都是1.5倍的，他说iTRAQ比2-DE灵敏不需要跟文献一样是1.5倍。这样真的可以吗？他如果这么确定差异倍数，会不会影响我的论文以及毕业啊？ |
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