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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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吴美儒

新虫 (小有名气)

[求助] 序列 已有3人参与

一段序列怎么查找其外显子和内含子呀？

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1楼 2017-02-22 14:17:54
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
NCBI里查基因，有全序列，并标注了外显子的范围。
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2楼2017-02-23 14:44:28
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秋水00仙素

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
在NCBI里面，别人上传序列里面一般会有exon（外显子）和intron（内含子），你点击后，在序列上面会以深底色呈现，如果没有看到exon）和intron，你也可点击“CDS”，一般CDS是外显子序列，其余部分内含子。内含子一般是GT.....AG，不知道能不能帮到你，祝好运！如果还有问题可以私下互相学习~
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3楼2017-02-23 15:11:45
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叶小宥

新虫 (小有名气)
Ncbi

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4楼2017-02-24 11:19:24
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781055707

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
外显子是根据随机表达的蛋白序列测序获得的。
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采菊东篱下，悠然见南山。
5楼2017-02-24 11:24:36
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快乐的牧羊人

金虫 (小有名气)
NCBI里面有基因全序列的，但是看外显子或者内含子要注意是哪个转录本，转录本不同外显子也不一样，我一般用ensembl.org，选择物种、转录本后左侧列表会显示exon，点进去就可以看到很详细的外显子序列，内含子只写出开头和结尾的几十bp，可对照NCBI数据找到。另外，不同数据库的数据会有偏差，但不会影响太大，自己取舍。再另，CDS一定是外显子组成的，但CDS是coding sequence，cDNA序列时才用，而我们用到的外显子组成的序列是mRNA。

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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

吴美儒
感悟生活
6楼2017-02-24 11:53:57
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吴美儒

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 快乐的牧羊人 at 2017-02-24 11:53:57
NCBI里面有基因全序列的，但是看外显子或者内含子要注意是哪个转录本，转录本不同外显子也不一样，我一般用ensembl.org，选择物种、转录本后左侧列表会显示exon，点进去就可以看到很详细的外显子序列，内含子只写出 ...

因为我做的是植物，我用这个ensembl.org的时候不知道选那个，好像都是动物

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7楼2017-02-24 13:38:13
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