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吴美儒新虫 (小有名气)
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一段序列怎么查找其外显子和内含子呀? 发自小木虫Android客户端 |
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4楼2017-02-24 11:19:24

5楼2017-02-24 11:24:36
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NCBI里面有基因全序列的,但是看外显子或者内含子要注意是哪个转录本,转录本不同外显子也不一样,我一般用ensembl.org,选择物种、转录本后左侧列表会显示exon,点进去就可以看到很详细的外显子序列,内含子只写出开头和结尾的几十bp,可对照NCBI数据找到。另外,不同数据库的数据会有偏差,但不会影响太大,自己取舍。再另,CDS一定是外显子组成的,但CDS是coding sequence,cDNA序列时才用,而我们用到的外显子组成的序列是mRNA。 发自小木虫Android客户端 |
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6楼2017-02-24 11:53:57
吴美儒
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