24小时热门版块排行榜    

查看: 3264  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

IRIS999

铁虫 (正式写手)

[求助] Forcite 几何优化有机小分子 已有1人参与

小白刚开始学习MS,目标是用MS算有机小分子的溶解度参数
在结构优化一步就被卡了好久,用amorphous cell构建了包含50个小分子的盒子,其中number of configurations用了默认的10
然后用Forcite做几何优化,能量图的X轴竟然是frame,只从1走到10,我想大概是算每个构型的能量吧,可是x轴不应该是优化步数吗?
为何优化一个小分子的时候X轴就是优化步数呀?优化盒子和小分子参数设置变化很大吗?
研究了MS8.0→Forcite→Calculation→Geometry Optimization里面所有需要设置的地方以及help里面都看不到涉及这个问题的解释,求大神给看看
回复此楼
复杂只是一种雾霭,有了阳光,它便消散。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

i799

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 月只蓝 at 2017-02-21 16:23:14
amorphous cell构建得到的xtd文件,打开,选择其中任一构型,复制该构型,然后粘贴到一个新建的xsd文件中,再对xsd文件做几何优化。
不要直接对xtd类型的结构做几何优化。

想问一下,结构优化过程的密度变化怎么看

发自小木虫IOS客户端
12楼2021-08-06 15:46:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

IRIS999

铁虫 (正式写手)

之前装的MS6.0用Discover模块的Smart Minizer做优化是好的,X轴是步数
但是装了MS8.0,听说Discover全部并入Forcite了,所以用了Forcite里面的Geometry Optimization,结果能量图的X轴变成了frame
复杂只是一种雾霭,有了阳光,它便消散。
2楼2017-02-21 14:00:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
IRIS999: 金币+8, ★★★★★最佳答案, 非常感谢,完美解决 2017-02-21 19:27:15
amorphous cell构建得到的xtd文件,打开,选择其中任一构型,复制该构型,然后粘贴到一个新建的xsd文件中,再对xsd文件做几何优化。
不要直接对xtd类型的结构做几何优化。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
3楼2017-02-21 16:23:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

引用回帖:
2楼: Originally posted by IRIS999 at 2017-02-21 14:00:06
之前装的MS6.0用Discover模块的Smart Minizer做优化是好的,X轴是步数
但是装了MS8.0,听说Discover全部并入Forcite了,所以用了Forcite里面的Geometry Optimization,结果能量图的X轴变成了frame

在有了Forite模块之后,Discover模块已经是鸡肋,8.0之后移除了Discover模块。
Forcite里面的Geometry Optimization没问题,是你操作的问题。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
4楼2017-02-21 16:25:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 304求调剂 +9 小熊joy 2026-03-14 9/450 2026-03-18 04:33 by anny19840123
[考研] 考研求调剂 +3 橘颂. 2026-03-17 4/200 2026-03-17 21:43 by 有只狸奴
[考研] 一志愿苏州大学材料工程(085601)专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +6 大火山小火山 2026-03-16 8/400 2026-03-17 15:05 by 无懈可击111
[考研] 290求调剂 +6 孔志浩 2026-03-12 11/550 2026-03-17 14:41 by 周舟舟77
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +3 困于星晨 2026-03-17 3/150 2026-03-17 14:08 by ms629
[考研] 08工科 320总分 求调剂 +4 梨花珞晚风 2026-03-17 4/200 2026-03-17 13:38 by houyaoxu
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
[考研] 东南大学364求调剂 +5 JasonYuiui 2026-03-15 5/250 2026-03-16 21:28 by 木瓜膏
[考研] 286求调剂 +3 lemonzzn 2026-03-16 5/250 2026-03-16 20:43 by lemonzzn
[考研] 环境工程调剂 +6 大可digkids 2026-03-16 6/300 2026-03-16 17:16 by barlinike
[考研] 283求调剂 +10 小楼。 2026-03-12 14/700 2026-03-16 16:08 by 13811244083
[考研] 285求调剂 +6 ytter 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:05 by njzyff
[考研] 080500,材料学硕302分求调剂学校 +4 初识可乐 2026-03-14 5/250 2026-03-14 21:08 by peike
[考研] 308求调剂 +5 是Lupa啊 2026-03-11 5/250 2026-03-13 22:13 by JourneyLucky
[考研] 求材料调剂 085600英一数二总分302 前三科235 精通机器学习 一志愿哈工大 +4 林yaxin 2026-03-12 4/200 2026-03-13 22:04 by 星空星月
[考研] 四川大学085601材料工程专硕 初试294求调剂 +4 祝我们好在冬天 2026-03-11 4/200 2026-03-13 21:39 by peike
[考研] 281求调剂 +9 Koxui 2026-03-12 11/550 2026-03-13 20:50 by Koxui
[考研] 求b区学校调剂 +3 周56 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:20 by JourneyLucky
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-12 10/500 2026-03-13 15:42 by ms629
[考研] 277求调剂 +4 anchor17 2026-03-12 4/200 2026-03-13 11:15 by 白夜悠长
信息提示
请填处理意见