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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 如何比对中两个蛋白质的保守结构域的匹配程度
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幻月zero

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何比对中两个蛋白质的保守结构域的匹配程度 已有1人参与

在NCBI上找到两个蛋白质，想看看他们在保守结构域的匹配程度有多少，请问各位大神这个怎么弄？或者需要什么软件？求详解
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1楼 2017-02-19 21:28:34
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keke226

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-02-22 06:43:17
幻月zero: 金币+5, ★有帮助 2017-03-07 17:39:51
你是想看一级序列的匹配程度还是想看三级结构的匹配程度？序列比对很多软件和网站都可以做，像vector NTI等等。三级结构比，对貌似pfam数据库有这个功能。或者直接将三级结构的PDB文件导入pymol进行比对。
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读书廿年倦写字，如今翻书不识志，若知眷书悔前程，无如渔樵未识时。三年担柴熟山性，三年苦网谙水汹，前程在心自倦舒，识志何用书中清。
2楼2017-02-21 23:22:55
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Pauline诗

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by keke226 at 2017-02-21 23:22:55
你是想看一级序列的匹配程度还是想看三级结构的匹配程度？序列比对很多软件和网站都可以做，像vector NTI等等。三级结构比，对貌似pfam数据库有这个功能。或者直接将三级结构的PDB文件导入pymol进行比对。

您好呀，请教一下如何PYMOL进行两个蛋白质的结构比对，我在网上看了很多教程都是讲通过PYMOL对蛋白质颜色啊什么的进行修饰。如果您知道如何比对能告诉我吗？非常感谢
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3楼2018-02-03 08:15:17
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