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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 核酸提取 » 分离甲基化DNA片段
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juxieyuan

新虫 (初入文坛)

[交流] 分离甲基化DNA片段

求师兄师姐赐教，请问用相关的内切酶切DNA链后，即将甲基化的片段切出来，然后有什么方法可以将甲基化的DNA片段与未甲基化的分开？

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1楼 2017-02-17 18:35:16
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drwhoknowss

荣誉版主 (正式写手)
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好像不能分开吧。bisulfate处理，然后deep sequencing。根据序列分开

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2楼2017-02-17 19:04:40
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juxieyuan

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by drwhoknowss at 2017-02-17 19:04:40
好像不能分开吧。bisulfate处理，然后deep sequencing。根据序列分开

那请问，要利用限制性内切酶将某段基因（例如启动子），是不是必须知道启动子与其他段基因的交界处的序列才能选出合适的酶？除了这个，有没有其他办法？

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3楼2017-02-18 14:54:10
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drwhoknowss

荣誉版主 (正式写手)
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从genomic DNA里不能切出来。 想要基因片段用pcr。想研究甲基化，先bisulfate处理，再pcr 测序

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4楼2017-02-18 17:14:10
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drwhoknowss

荣誉版主 (正式写手)
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-02-18 22:11:52
引用回帖:
3楼: Originally posted by juxieyuan at 2017-02-18 14:54:10
那请问，要利用限制性内切酶将某段基因（例如启动子），是不是必须知道启动子与其他段基因的交界处的序列才能选出合适的酶？除了这个，有没有其他办法？
...

切不出来的原因是：基因组太大。切完各样大小的片段都有，没法分离。
pcr要求知道序列，然后才能设计引物

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5楼2017-02-18 17:16:13
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