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xiaowandouer木虫 (正式写手)
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[交流]
【求助】高斯中的BOMD
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最近想试着用高斯中的BOMD算点动力学，把手册中例子的基组换成了自定义基组（因为自己的体系会用到自定义基组），可是总报L118错 WANTED A FLOATING POINT NUMBER AS INPUT. （有时候是wanted an integer） FOUND A STRING AS INPUT. c o h 0 ? Error termination via Lnk1e in /home/gauss/g03/l118.exe at Wed Dec 17 15:38:52 2008. 难道BOMD和自定义基组无法同时使用？ 麻烦知道的虫友指点一下，谢谢 |
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xiaowandouer
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to erylingjet: 这些是对应命令行设置的参数。 仔细考虑了下上面列出的问题，其实问题不在自定义基组上，只要把六项终止标准全部列上（还是期望能像手册中提到的那样，只列一两项，可是现在没搞懂），就可以跑。如果跑不出预想的构型，加个动能就可以了。morse参数似乎不是必须的。 另外上面说的神奇问题其实不神奇，因为对H来说3-21g和6-31g*不会引起基函数个数的变化，只是高斯函数会发生变化，这个自己动手算下就好。昨天自己有点犯傻，呵呵 还是希望能和做BOMD的虫友多多交流，上面只是自己一点肤浅的认识 |
9楼2008-12-18 16:12:34
xiaowandouer
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现在看来如果想让输入文件跑起来，只要仔细阅读手册上关于BOMD的介绍就好，所得结果的好赖，后续的分析等等这方面的经验我也很缺乏，很希望有经验的虫友能来讲讲 补充：我前几天比较迷惑的终止标准问题，现在稍有进展。就像手册上说的那样你可以任意设置六项中的一项或者若干项，只是把不设置的项写上0（0表示关闭这些终止标准），见手册原话“a value of zero for any parameter turns off testing for the corresponding stopping criteria.” |
11楼2008-12-19 09:24:41
yyx19840628
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3楼2008-12-17 19:18:39
quantumor
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5楼2008-12-17 22:11:38
xiaowandouer
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最近这两天刚开始接触BOMD，计算的经验是一点都没有，所以问题一大堆，恳请有相关计算经验的虫友们多多指点。，本人会用金币答谢（虽然热心的虫友并不是冲着金币来的，O(∩_∩)O…………）下面上问题 ************************************************************** 手册上说，在大多数情况下，终止标准取一两项就足够了，利用手册上给的例子，我做了下测验，发现完全不是这么回事。 1. # 输入文件与例子相同，只是按照从后往前的顺序，每次去掉一个标准或者n<6个标准，可以算； # 如果是自定义基组则不能算（这儿可以确定不是自定义基组格式的问题，后面会提到）； # 如果任意去掉1-5中的任意一个标准，也不能算； 我的问题是：出现上述情况的原因是什么呢？什么样的情况（也就是例子说的大多数情况）下，终止标准只需要一两项就可以？什么样的情况下需要输入更多项？如果我只输入R1，R4两项标准，那么程序能否给识别出来？也就是说终止标准的输入次序打乱后，程序能否识别？ *********************************************************************************** 2.关于自定义基组 #与例子用的基组相同，只是将其写成自定义的形式，可以算； #把基组改变，C，O定义为3-21g基组；H定义为6-31g*基组，可以算，但是奇怪的问题产生了，检查两个输 出文件，竟然发现基函数的个数相同！！！很神奇！！！（可以排除自定义基组格式的问题，因为如果不 对，程序不会往下跑）； #用自定义基组跑成功的输入文件，去掉终止标准的任何一项都不能跑。 问题：自定义基组跟终止标准间有什么关系？ 附上我的自定义基组的输入文件 # hf gen BOMD(Phase=(1,3),RTemp=300,NSample=1,ReadStop) Geom=Crowd xxxx 0 1 C O 1 r1 H 1 r2 2 a H 1 r3 3 b 2 180. r1 1.15275608 r2 1.74415774 r3 1.09413376 a 114.81897892 b 49.08562961 1 1 1 2 2 13.0 11.0 1.3 2.5 0.0000005 1 5.145 C O -112.09329898 1.12895435 0.49458169 2.24078955 H H -1.12295984 0.73482237 0.19500473 1.94603924 c o h 0 3-21g **** 基本就是在这个文件上修修改改 ********************************************************************************** 3. 初始动能如何确定？ 4. Morse参数如何确定？ [ Last edited by xiaowandouer on 2008-12-18 at 12:05 ] |
6楼2008-12-18 09:30:19
xiaowandouer
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8楼2008-12-18 13:35:58
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标记。我也很想做BOMD，苦于自己很愚钝阿，LZ学会了可以开个贴讲讲。
10楼2008-12-18 21:25:02