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mikufan

金虫 (小有名气)

[求助] 用什么软件可以构建高分子量的聚合物初始结构

我是用lammps来跑聚合物的动力学模拟,之前都是用MS来构建聚合物的初始结构。现在想跑个链长较长的PE链(3500个单体)的模拟,但是MS只能搭建到2000个单体。想问还有其他的软件可以构建聚合物的初始结构吗?
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一区的paper好难发T-T
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缘自阳光

新虫 (初入文坛)

可以考虑采用自避无规行走建立初始模型,然后再优化,MS建大体系会报错。
2楼2017-02-10 16:23:33
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mikufan

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 缘自阳光 at 2017-02-10 16:23:33
可以考虑采用自避无规行走建立初始模型,然后再优化,MS建大体系会报错。

不是很懂,请问是用软件搭建还是自己写程序搭建啊?
一区的paper好难发T-T
3楼2017-02-11 08:28:48
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

大分子量,而且结构规则,我觉得可以考虑建mesostructure,跑模拟的话一般会用dpd、mesodyn、mesocite这类模块,你可以先help里看看资料
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
4楼2017-02-13 09:44:37
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cuihuina

银虫 (小有名气)

楼主,我想问一下你:我是在MS构建的聚合物,然后构建的无定形晶胞,再能量最小化输出LAMMPS需要的初始构想文件。这样可以吗?
天道酬勤
5楼2017-04-13 16:12:28
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ShirineLiAng

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by mikufan at 2017-02-11 08:28:48
不是很懂,请问是用软件搭建还是自己写程序搭建啊?...

同问啊!没看明白。。。。
6楼2017-12-07 13:41:25
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543760860

新虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by mikufan at 2017-02-11 08:28:48
不是很懂,请问是用软件搭建还是自己写程序搭建啊?...

请问lammps中怎么采用自避无规行走建立初始模型,十分感谢
7楼2019-08-20 15:16:05
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543760860

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 缘自阳光 at 2017-02-10 16:23:33
可以考虑采用自避无规行走建立初始模型,然后再优化,MS建大体系会报错。

lammps中怎么采用自避无规行走建立初始模型,十分感谢
8楼2019-08-20 15:17:27
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