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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 用什么软件可以构建高分子量的聚合物初始结构
汕头大学海洋科学接受调剂
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mikufan

金虫 (小有名气)

[求助] 用什么软件可以构建高分子量的聚合物初始结构

我是用lammps来跑聚合物的动力学模拟，之前都是用MS来构建聚合物的初始结构。现在想跑个链长较长的PE链（3500个单体）的模拟，但是MS只能搭建到2000个单体。想问还有其他的软件可以构建聚合物的初始结构吗？
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一区的paper好难发T-T
1楼 2017-02-10 15:04:46
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缘自阳光

新虫 (初入文坛)
可以考虑采用自避无规行走建立初始模型，然后再优化，MS建大体系会报错。
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2楼2017-02-10 16:23:33
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mikufan

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 缘自阳光 at 2017-02-10 16:23:33
可以考虑采用自避无规行走建立初始模型，然后再优化，MS建大体系会报错。

不是很懂，请问是用软件搭建还是自己写程序搭建啊？
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一区的paper好难发T-T
3楼2017-02-11 08:28:48
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
大分子量，而且结构规则，我觉得可以考虑建mesostructure，跑模拟的话一般会用dpd、mesodyn、mesocite这类模块，你可以先help里看看资料
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#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
4楼2017-02-13 09:44:37
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cuihuina

银虫 (小有名气)
楼主，我想问一下你：我是在MS构建的聚合物，然后构建的无定形晶胞，再能量最小化输出LAMMPS需要的初始构想文件。这样可以吗？
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天道酬勤
5楼2017-04-13 16:12:28
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ShirineLiAng

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by mikufan at 2017-02-11 08:28:48
不是很懂，请问是用软件搭建还是自己写程序搭建啊？...

同问啊！没看明白。。。。
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6楼2017-12-07 13:41:25
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543760860

新虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by mikufan at 2017-02-11 08:28:48
不是很懂，请问是用软件搭建还是自己写程序搭建啊？...

请问lammps中怎么采用自避无规行走建立初始模型，十分感谢
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7楼2019-08-20 15:16:05
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543760860

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 缘自阳光 at 2017-02-10 16:23:33
可以考虑采用自避无规行走建立初始模型，然后再优化，MS建大体系会报错。

lammps中怎么采用自避无规行走建立初始模型，十分感谢
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8楼2019-08-20 15:17:27
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