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vallen

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助】在高斯里怎样固定一组原子(不是固定坐标)

即固定一组原子间的相对位置
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1楼 2008-12-16 11:50:30
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
这和固定键长,应该是一个道理吧?
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2楼2008-12-16 12:39:58
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
赞同楼上的，你的意思不太明白
赞一下 回复此楼
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
3楼2008-12-16 13:43:43
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yuan888

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢
楼主去我博客里看一下 有个部分固定的 文章 看看就知道了http://hi.baidu.com/xiaoyuan230231
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4楼2008-12-20 12:16:38
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
如果用的是笛卡尔坐标，把第二列改成-1 为固定坐标，改成比-1 还要小的数（比如-2）为你的要求
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5楼2008-12-28 12:40:36
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
用内坐标好办一些。
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6楼2008-12-29 08:31:13
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gaoyp0114

木虫 (小有名气)
在输入文件的最后一行加上类似下面命令：例如
2  7  1.50  f
（注：2 7分别为要固定的两原子编号，1.50是固定的键长，f表示固定，若放开则为a）
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7楼2008-12-29 11:06:43
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gaoyp0114

木虫 (小有名气)
哦，抱歉，没看清楚。。。
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8楼2008-12-29 11:07:52
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lianghust

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
gwdavid(金币+2,VIP+0):谢谢
＃ HF/6-31G geom=modred opt

opt

0 1
C                  0.00000000    0.00000000    0.00000000
H                  0.00000000    0.00000000    1.06999996
H                 -0.00000000   -1.00880563   -0.35666665
H                 -0.87365130    0.50440282   -0.35666665
H                  0.87365130    0.50440282   -0.35666665

B  1  2   2.0   F   !固定键长
A  1 2 3  120.0  F  ! 固定键交
D  1 2 3 4  120.0  F ！固定二面角

不知道楼主想知道的是不是这个！！
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9楼2008-12-29 11:44:13
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