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xiaxue_121

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】计算静电势

首先多谢quantumor  兄的帖子,让我学会了用Gview做出分子的静电势。

但是现在碰到一个问题,我在优化完分子结构以后,在linux下将chk文件生成fchk文件,再用gview打开,但是打开以后发现分子结构与初始的输入文件一样,完全不是优化后得到的稳定构型。这样做出来的静电势到底是初始构型的静电势还是最终构型的静电势?

如果想要得到稳定构型的静电势要如何操作呢?

多谢各位。

[ Last edited by xuefei06 on 2009-1-16 at 21:50 ]
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quantumor

金虫 (著名写手)

快乐兔子

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xiaxue_121(金币+10,VIP+0):多谢quantumor,忽略了最简单的东西
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢
如果你做了结构优化,你的chk文件中的结构一定会与输入文件中的不完全相同;你需要同时打开输入文件的结构和chk文件中的结构,然后分别测定对应的结构数据进行对比,以判断两者的结构是否相同,而不能仅凭外观上图形的形状来说明两者是否一致。
愿好运与快乐伴随你!
5楼2008-12-17 11:59:54
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wgpig

木虫 (小有名气)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 4-30 13:24


翻一下Gaussian的手册,和鼠标点点Gv都这么困难么。
3楼2008-12-16 15:59:50
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xiaxue_121

木虫 (正式写手)

麻烦可以说得详细点吗?
我从fchk里面只能得到我的输入构型,请问是怎么回事呢?
4楼2008-12-17 10:49:43
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chuchu6816

金虫 (正式写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):鼓励新虫发言 4-30 13:24
chk 文件就可以用Gview打开做静电势图
6楼2009-04-29 10:23:04
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