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anvier

木虫 (正式写手)

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[交流] 【求助】双核单机VASP并行安装（有效期2009.1.1)

以下是我安装VASP的全过程，请高手指点哪里出问题了。
当前是双核CPU，单机，SUSE 10的32位系统。

1.已成功安装好intel fortran 9.1.036和intel MKL 8.1.1数学库；
放置路径为：/opt/intel/fc/9.1.036/和/opt/intel/mkl/8.1.1/。
并已设置好环境变量，通过$LD_LIBRARY_PATH命令查看结果为：
linux-a86d:~ # $LD_LIBRARY_PATH
bash: /opt/intel/mkl/8.1.1/lib/32:/opt/intel/fc/9.1.036/lib: No such file or directory
linux-a86d:~ #

2.下载mpich-1.2.7p1，并安装。
使用命令tar xzvf mpich.tar.gz 来解压它。得到mpich-1.2.7p1目录。
进入该目录，以此使用下面的命令：
a) ./configure  --prefix=/usr/local/mpich -rsh=ssh  --with-cflags=-O \
-f90="ifc -FR -lowercase"  --with-f77flags=-O --without-romio -fc=ifc
b) make
c)改用root帐号，进入改目录进行安装。
make install
则把mpich安装到/usr/local/mpich目录。

3.设置与mpich有关的环境变量
在主目录下把下面的几行加入.bash_profile文件中
export PATH=$PATH:/usr/local/mpich/bin
export MPI_USEP4SSPORT=yes
export MPI_P4SSPORT=22
export P4_RSHCOMMAND=ssh
然后采用下面的命令更新该文件
source /.bash_profile

4.采用mpif90来编译vasp
a)进入vasp.4.lib目录中，把 makefile.linux_ifc_P4 拷贝成makefile(cp makefile.linux_ifc_P4 makefile)。
键入make命令，开始编译得到libdmy.a
b)进入vasp.4.6目录中，把makefile.linux_ifc_P4拷贝成makefile
把第50行的FC=ifc前加上注释号，也就是#
第80行至82行的CPP有关内容加上注释号，改成下面的
#CPP    = $(CPP_)  -DHOST=\"LinuxIFC\" \
#       -Dkind8 -DNGXhalf -DCACHE_SIZE=12000 -DPGF90 -Davoidalloc \
#       -DRPROMU_DGEMV  -DRACCMU_DGEMV
把第136行的BLAS改成
BLAS=  -L/opt/intel/mkl/8.1.1/lib/32 -lmkl_p4 -lsvml -lvml -lguide -lpthread
把第166行和167行有关FFT3D的行前加上注释号，如下面的
#FFT3D = fft3dfurth.o fft3dlib.o
#FFT3D = fftw3d.o fft3dlib.o /opt/libs/fftw-3.0.1/lib/libfftw3.a
把202行和203行的FC等改为如下的内容：
FC=mpif90
FCL=$(FC)
把212行有关CPP的行前的注释号去掉，改成如下的内容：
CPP = $(CPP_) -DMPI  -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC \
      -Dkind8 -DNGZhalf -DCACHE_SIZE=4000 -DPGF90 -Davoidalloc \
      -DMPI_BLOCK=500  \
      -DRPROMU_DGEMV  -DRACCMU_DGEMV
把226和227行有关SCA的行，加上注释号，改成如下的
#SCA= $(SCA_)/libscalapack.a  \
#$(BLACS)/LIB/blacsF77init_MPI-LINUX-0.a $(BLACS)/LIB/blacs_MPI-LINUX-0.a $(BLACS)/LIB/blacs       F77init_MPI-LINUX-0.a
表示不用scalapack库。
把239和243行有关FFT3D的行，改成如下的内容：
# FFT: fftmpi.o with fft3dlib of Juergen Furthmueller
FFT3D = fftmpi.o fftmpi_map.o fft3dlib.o

# fftw.3.0.1 is slighly faster and should be used if available
#FFT3D = fftmpiw.o fftmpi_map.o fft3dlib.o /opt/libs/fftw-3.0.1/lib/libfftw3.a
把这些都修改后，保存。
（以上过程都十分顺利地完成了。）
再make。
然后就出现以下的错误，
linux-a86d:/tmp/vasp.4.6 # make
./preprocess fftmpi.f90 -DMPI  -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC -Dkind8 -DNGZhalf -DCACHE_SIZE=2000 -DPGF90 -Davoidalloc -DRPROMU_DGEMV  -DRACCMU_DGEMV -DMPI_BLOCK=1000
mpif90 -FR -lowercase  -O3 -xW -tpp7  -c fftmpi.f90
make: mpif90: Command not found
make: *** [fftmpi.o] Error 127
linux-a86d:/tmp/vasp.4.6 #

[ Last edited by wuchenwf on 2009-6-22 at 21:40 ]

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